1998 entdeckten Rogakou, Pilch, Orr und Bonner, dass jeder DNA-Doppelstrangbruch eine Phosphorylierung des Histons H2AX auslöst und dadurch am Schadensort einen sichtbaren Focus erzeugt. Ein… Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=MGj7fIstgC4
Zellzählung klingt einfach, ist es aber nicht. Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=9mB6o2GWqdg
Die Kolokalisationsanalyse hat ein Imageproblem. Jahrelang bestand die gängige Praxis darin, den roten und den grünen Kanal zu überlagern, nach Gelb zu suchen und Kolokalisation zu erklären. Dieser… Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=uf0FLNjSNJ8
Bakterielle Infektion ist ein Zahlenspiel, das Zelle für Zelle gespielt wird. Wie viele Wirtszellen wurden getroffen, und wie stark? Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=UEn5mqnrROk
Die meisten Forschenden nehmen Mikroskopiebilder auf und beschreiben dann mit Adjektiven, was sie sehen: Die Zellen wirken größer, sie scheinen nach der Behandlung runder zu sein. Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=3_ZQGB8qcyY
Das ist nicht ein einzelner Assay. Es ist die Fähigkeit, auf der die halbe moderne Zellbiologie beruht. γH2AX-Foci. RNAscope-Punkte. PLA-Puncta. Stressgranula. P-Bodies. PML-Körperchen. Erregerzellen.… Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=Kdvpba7jLF0
Lysosomen stehen im Zentrum von Neurodegeneration, lysosomalen Speicherkrankheiten, mTOR-Signalwegen und einer rasch wachsenden Pipeline von Autophagie-Modulatoren.
Der spektakuläre Rand der multiplexierten Bildgebung sorgt für die Schlagzeilen. CODEX, MIBI, IMC. 40 und mehr Marker gleichzeitig. Diese sind real und wichtig, aber sie sind nicht die Art und Weise, wie die meiste Biologie betrieben wird.
Die Zählung von Foci wird als Einzelkanal-Problem behandelt. Ein Marker, eine Bedingung, eine Anzahl pro Zelle. Damit ist ein Teil der Frage beantwortet.
Den größten Teil des 20. Jahrhunderts galten Lipidtröpfchen als inerte Klumpen gespeicherten Fetts. Diese Sichtweise brach um die Jahrtausendwende mit der Entdeckung der Periline zusammen und…
Die Zählung von Parasiten innerhalb von Wirtszellen ist ein zentrales Auslesesignal in der Wirkstoffforschung gegen Parasiten. Der Anteil infizierter Zellen, die Anzahl der Parasiten pro Zelle oder die Intensität des Parasitensignals lassen sich allesamt auf eines reduzieren…
Einige der wichtigsten Fragen der Zellbiologie betreffen nicht die Zellen selbst, sondern das, was sich in ihrem Inneren befindet. Wie viele Mitochondrien pro Zelle? Wie viele DNA-Schadens-Foci pro Zellkern? Wie viele…
Die Translokation von NF-κB in den Zellkern ist eines der am besten untersuchten Ereignisse der Entzündungsbiologie. Das Shuttling von YAP/TAZ ist das Auslesesignal des Hippo-Signalwegs und von entscheidender Bedeutung bei Krebs und…
Ein Wirkstoff ist nutzlos, wenn er nicht in die Zelle gelangt. Dies ist die zentrale Herausforderung für Lipid-Nanopartikel, zellpenetrierende Peptide, Antikörper-Wirkstoff-Konjugate und RNA…
1882 stach Élie Metschnikow einen Rosendorn in eine Seesternlarve und beobachtete, wie Zellen herbeiströmten, um ihn zu umschließen. Diese Beobachtung, dass Zellen Fremdkörper fressen, wurde zu einem Grundpfeiler… Sehen Sie die Analyse in Aktion: https://youtube.com/watch?v=ezaikU7ix1I
Das Wirkstoffscreening in der Onkologie ist von Natur aus iterativ. Verbindungen werden getestet, verfeinert und erneut getestet. Das Team, das noch am selben Tag Proliferationsdaten zurückerhält, führt die nächste Iteration durch…
Niemand veröffentlicht eine Arbeit über Transfektionseffizienz. Niemand gewinnt dafür ein Forschungsstipendium. Doch jedes CRISPR-Experiment, jede Überexpressionsstudie, jeder Produktionslauf viraler Vektoren…
Die Analyse des Zellzyklus ist entscheidend für das Verständnis von Proliferation und Krankheit. Während Hochdurchsatzmethoden räumliche Informationen opfern, ermöglicht Cytely die schnelle Klassifizierung von Zellzyklusstadien allein anhand einer Kernfärbung und morphologischer Profilierung – dabei bleibt der räumliche Kontext erhalten und eine reproduzierbare Quantifizierung wird ermöglicht.
Smart Microscopy verändert die Lebenswissenschaften, indem sie experimentelle Bildgebungs-Workflows automatisiert und eine Anpassung in Echtzeit auf Basis von Rückmeldungen aus Bildern und anderen Datenströmen ermöglicht. Dieser Wandel steigert den Durchsatz, verbessert die Reproduzierbarkeit und erweitert die funktionalen Möglichkeiten von Mikroskopen
Die Analyse von Zellpopulationen im Vollblut ist eine grundlegende und zugleich anspruchsvolle Aufgabe. Selbst nach den üblichen Präparationsschritten enthalten Proben häufig gemischte Populationen aus Leukozyten, Thrombozyten und Erythrozyten (RBCs). Cytely ermöglicht es Forschenden, diese Populationen auf Einzelzellebene schnell zu identifizieren und zu quantifizieren. Über Scatter-Plots und intuitives Gating lassen sich verschiedene Blutzelltypen in einem unvoreingenommenen, interaktiven Workflow unterscheiden und charakterisieren. In dieser Application Note demonstrierte Kernfunktionen: Visualisierung der Heterogenität über eine gemischte Zellpopulation hinweg Identifizierung von Populationen (Neutrophile, Thrombozyten, RBCs) mithilfe von Scatter-Plots Gating zur Isolierung von Neutrophilen-Subpopulationen
Erfahren Sie, wie Sie Phagozytose-Experimente mit Cytely analysieren.
Hier betrachten wir eine einfache Blutprobe, die für Zellkerne, Zytosol und Membran gefärbt wurde. Erythrozyten und Thrombozyten haben wir problemlos anhand ihres fehlenden Kernsignals und ihrer geringeren Größe herausgegatet, während Neutrophile durch ihre starke nukleäre und zytosolische Färbung deutlich hervortraten. Normalerweise würden Sie mehrere Antikörper oder eine Erythrozyten-Lyse benötigen, um diese Trennung zu erreichen, doch mit Cytely gelingt dies in einem einzigen Workflow – dabei bleibt der räumliche Kontext Ihrer Probe erhalten und die gesamte Analyse ist in wenigen Minuten abgeschlossen.
In der Mikroskopie stellt der Übergang von der qualitativen Beobachtung zu quantitativen Daten eine erhebliche Herausforderung dar. Die manuelle Analyse ist anfällig für Verzerrungen durch den Anwender und für große Datensätze unpraktikabel, während viele automatisierte Lösungen den Zusammenhang zwischen den quantitativen Daten und dem ursprünglichen visuellen Kontext verschleiern können. Cytely ist ein webbasiertes Tool, das diese Herausforderungen adressiert, indem es die automatisierte Bildsegmentierung mit der interaktiven Datenexploration verbindet. Es bietet einen strukturierten Workflow, um quantitative Kennzahlen aus Zellpopulationen abzuleiten und diese Kennzahlen in Echtzeit mit ihren Ausgangsbildern zu verknüpfen.
Moderne Mikroskopie-Plattformen erzeugen Datensätze von erheblichem Umfang und erfassen routinemäßig 10.000–100.000 Zellen pro Versuchsbedingung. Analytische Einschränkungen begrenzen die Quantifizierung jedoch häufig auf kleine Teilmengen, typischerweise 100–1.000 Zellen, was weniger als 1 % der verfügbaren Daten entspricht. Diese systematische Unterstichprobenahme führt zu einem Selektions-Bias, verringert die statistische Aussagekraft und verschleiert die Heterogenität der Population. Wir untersuchen die methodischen Folgen der unvollständigen Datennutzung und stellen die automatisierte High-Content-Analyse als Lösung für das Missverhältnis zwischen der Kapazität der Datenerfassung und dem analytischen Durchsatz vor.
Die moderne Fluoreszenzmikroskopie erzeugt hochauflösende Bilddaten, die aufgrund analytischer Engpässe in den Quantifizierungs-Workflows weitgehend ungenutzt bleiben. Während die Durchflusszytometrie strenge Standards für die Einzelzellanalyse auf Populationsebene etabliert hat, stützen sich mikroskopiebasierte Ansätze in der Regel auf die manuelle Auszählung begrenzter Stichprobengrößen, was die statistische Aussagekraft einschränkt und die Heterogenität der Population verschleiert. Diese Perspektive plädiert für die systematische Anwendung zytometrischer Prinzipien auf die bildbasierte Analyse, um Forschenden zu ermöglichen, die räumlichen und morphologischen Vorteile der Mikroskopie zu nutzen und zugleich die für durchflussbasierte Methoden charakteristische statistische Aussagekraft zu erreichen.