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Die meisten Forschenden nehmen Mikroskopiebilder auf und beschreiben dann mit Adjektiven, was sie sehen: Die Zellen wirken größer, sie scheinen nach der Behandlung runder zu sein.

Das sind echte Beobachtungen. Die Morphologie ist einer der frühesten und empfindlichsten Indikatoren für Wirkstoffeffekte, Toxizität und Differenzierung. Doch Adjektive lassen sich nicht statistisch testen.

Cytely erfasst Fläche, Zirkularität, Elongation, Umfang und Mehrkanal-Intensität für jede einzelne Zelle. So wird visuelle Intuition zu Zahlen und Zahlen zu gatebaren Populationen. Die Zellen, die „anders aussehen“, werden zu einem definierten Cluster in einem Streudiagramm, den Sie quantifizieren, zwischen Bedingungen vergleichen und reproduzieren können.

Die Morphologie ist die kostengünstigste und informationsdichteste Messgröße im phänotypischen Screening. Außer einer Kernfärbung und einem Zellkörpermarker sind keine speziellen Reagenzien erforderlich. KI-gestützte Phänomik gehört zu den am schnellsten wachsenden Bereichen der Wirkstoffforschung, und sie beginnt mit einer zuverlässigen Morphologieerfassung pro Zelle.

So läuft der Assay ab

Zellkerne aus DAPI segmentieren → optional zur ungefähren Zellgrenze erweitern oder einen zweiten Kanal für die Zellkörper-Segmentierung nutzen → morphologische und Intensitätsmerkmale pro Zelle über alle Kanäle messen → interaktiv mit 2D-Streudiagrammen erkunden und gaten.

Was Sie bereitstellen

  • Ch1: DAPI (Kernfärbung)
  • Ch2-4: Zellkörperfärbung, Zytoskelettmarker oder Kanäle für Zielproteine (IF oder Fluoreszenz-Tags)

Was Sie erhalten

  • Fläche
  • Zirkularität
  • Elongation (Verhältnis Haupt-/Nebenachse)
  • Umfang pro Zelle
  • Mittlere/mediane/minimale/maximale Intensität pro Kanal

Einsatzbereit

Rein nukleäre Morphologie, Ganzzell-Morphologie (mit Zellkörperfärbung), mehrkanaliges Intensitätsprofiling (bis zu 4 Kanäle), Hellfeld-Zellsegmentierung, interaktives Populations-Gating zur Zelltyp-Klassifizierung, Zellspreitungsflächen-/Substratspreitungs-Assays (Phalloidin/F-Aktin), Thrombozyten-Spreitungsmorphometrie.

Für Unterstützung anfragen

Texturmerkmale (Haralick), auf maschinellem Lernen basierende Phänotyp-Klassifikatoren, Zellform-Embeddings.

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