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Das ist nicht ein einzelner Assay. Es ist die Fähigkeit, auf der die halbe moderne Zellbiologie beruht. γH2AX-Foci. RNAscope-Punkte. PLA-Puncta. Stressgranula. P-Bodies. PML-Körperchen. Erregerzellen. Lipidtröpfchen. Synaptische Puncta. Wirkstoffaggregate. Sie alle sind dasselbe analytische Problem: kleine, helle Objekte in Zellen, die pro Zelle detektiert, gezählt und gemessen werden müssen.

Die manuelle Variante, bei der Forschende mit zusammengekniffenen Augen auf Bilder starren, Punkte anklicken und Zählungen in eine Tabelle eintragen, ist einer der häufigsten Zeitfresser in der biologischen Forschung. Ein einzelnes DNA-Schadensexperiment kann das Zählen von Foci in über 200 Zellkernen erfordern. Ein RNAscope-Experiment vervielfacht das mit der Anzahl der Sondenkanäle.

Die Spot-Detektions-Engine von Cytely ist das gemeinsame Fundament all dieser Assays. Sie detektiert Puncta, misst Anzahl, Fläche und Intensität pro Zelle und speist diese Messwerte in dieselbe interaktive Gating- und Bildverknüpfungsoberfläche ein, auf der jede andere Cytely-Analyse beruht.

So läuft der Assay ab

Zellkerne/Zellen aus DAPI segmentieren → Puncta im Zielkanal detektieren → pro Zelle zählen und messen.

Was Sie bereitstellen

  • Ch1: DAPI
  • Ch2: Kanal mit punktförmigen Strukturen (IF, FISH-Sonde oder Fluoreszenz-Tag)

Was Sie erhalten

  • Spot-Anzahl pro Zelle
  • Gesamte Spot-Fläche pro Zelle
  • % Zellen mit Spots
  • Messwerte pro Spot (Fläche
  • Mittlere/mediane/minimale/maximale Intensität
  • Integrierte (Summen-)Intensität
  • Zirkularität
  • Elongation (Verhältnis Haupt-/Nebenachse), Orientierung, Schwerpunktposition)

Einsatzbereit

DNA-Schadensfoci (γH2AX, 53BP1, RAD51), RNA-Puncta (RNAscope, smFISH), Stressgranula (G3BP1), P-Bodies (DCP1A), PML-Körper, synaptische Puncta, Rezeptorcluster, Wirkstoffaggregate, Viruspartikel, Lipidtröpfchen, jede subzelluläre punktförmige Struktur.

Für Unterstützung anfragen

3D-Spot-Detektion in Z-Stacks, Spot-Tracking über die Zeit.

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