Der spektakuläre Rand der multiplexierten Bildgebung sorgt für die Schlagzeilen. CODEX, MIBI, IMC. 40 und mehr Marker gleichzeitig. Diese sind real und wichtig, aber sie sind nicht die Art und Weise, wie die meiste Biologie betrieben wird.
Die spektakuläre Speerspitze der Multiplex-Bildgebung macht die Schlagzeilen. CODEX, MIBI, IMC. Über 40 Marker gleichzeitig. Diese Methoden sind real und wichtig, aber so wird der Großteil der Biologie nicht betrieben.
Das eigentliche Arbeitspferd ist das IF-Panel mit 2 bis 4 Kanälen. DAPI plus zwei oder drei Marker, ausgewählt, um eine ganz bestimmte Frage zu beantworten. Wird dieses Protein in diesem Zelltyp exprimiert? Verschiebt die Verbindung die Population? Kolokalisieren die Marker A und B? Diese Experimente laufen täglich in jedem zellbiologischen Labor und liefern die meisten Abbildungen in den meisten Publikationen.
Das Analyseproblem ist in der Mikroskopie überall dasselbe: Messwerte pro Zelle über alle Kanäle extrahieren und anschließend multiparametrische Daten interpretieren. Den konzeptionellen Rahmen dafür hat die Durchflusszytometrie entwickelt: Populationen in 2D-Streudiagrammen gaten, Subpopulationen über Markerkombinationen definieren, Prozentsätze pro Gate angeben.
Cytely überträgt dieses Gating im Stil der Durchflusszytometrie auf Bilder. Zellen segmentieren, alle Kanäle und Morphologiemerkmale pro Zelle messen, interaktiv auf jeder beliebigen 2D-Kombination gaten. Jede gegatete Zelle ist mit ihrer Position im Bild verknüpft.
Das IF-Panel mit 2 bis 4 Kanälen ist der Grund, warum sich jeder Cytely-Workflow ohne experimentspezifisches Scripting aus derselben Plattform ergibt.
So läuft der Assay ab
Zellen segmentieren → alle Kanalintensitäten und Morphologie pro Zelle messen → multiparametrische Beziehungen über interaktives Gating erkunden.
Was Sie bereitstellen
- Ch1: DAPI
- Ch2-4+: Markerkanäle (IF, Fluoreszenz-Tags oder Multiplex-Färbungen)
Was Sie erhalten
- Intensität pro Zelle für jeden Marker
- Morphologiemerkmale
- Ko-Expressionsprofile
- Verteilungen auf Populationsebene
Einsatzbereit
IF-Panels mit 2-4 Kanälen, Immunphänotypisierungspanels, Multi-Target-Wirkstoffstudien, jede Kombination aus nukleären + zytoplasmatischen + Membranmarkern.
Für Unterstützung anfragen
Spektrale Entmischung, zyklische IF (aufeinanderfolgende Färberunden), >4 gleichzeitige Kanäle.