En 1998, Rogakou, Pilch, Orr et Bonner ont découvert que chaque cassure double brin de l'ADN déclenche la phosphorylation de l'histone H2AX, formant un focus visible au site de la lésion. Un… Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=MGj7fIstgC4
Compter des cellules paraît simple, mais ne l'est pas. Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=9mB6o2GWqdg
L'analyse de colocalisation souffre d'un problème de réputation. Pendant des années, la pratique courante consistait à fusionner les canaux rouge et vert, à chercher du jaune et à déclarer une colocalisation. Cette… Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=uf0FLNjSNJ8
L'infection bactérienne est une affaire de chiffres, qui se joue cellule par cellule. Combien de cellules hôtes ont été touchées, et avec quelle intensité ? Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=UEn5mqnrROk
La plupart des chercheurs acquièrent des images de microscopie, puis décrivent ce qu'ils voient avec des adjectifs : les cellules semblent plus grandes, elles paraissent plus arrondies après traitement. Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=3_ZQGB8qcyY
Il ne s'agit pas d'un test unique, mais de la capacité qui alimente la moitié de la biologie cellulaire moderne. Foci γH2AX. Points RNAscope. Puncta PLA. Granules de stress. Corps P. Corps PML. Cellules pathogènes.… Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=Kdvpba7jLF0
Les lysosomes sont au cœur de la neurodégénérescence, des maladies de surcharge lysosomale, de la signalisation mTOR et d'un pipeline en pleine expansion de modulateurs de l'autophagie.
La pointe spectaculaire de l'imagerie multiplexée fait les gros titres. CODEX, MIBI, IMC. Plus de 40 marqueurs à la fois. Ces techniques sont réelles et importantes, mais ce n'est pas ainsi que se fait la majeure partie de la biologie.
Le comptage de foci est souvent traité comme un problème à un seul canal. Un marqueur, une condition, un décompte par cellule. Cela ne répond qu'à une partie de la question.
Pendant la majeure partie du XXe siècle, les gouttelettes lipidiques ont été considérées comme d'inertes amas de graisse stockée. Cette vision s'est effondrée au tournant du millénaire avec la découverte des périlipines et…
Le comptage des parasites à l'intérieur des cellules hôtes est une lecture essentielle dans la découverte de médicaments antiparasitaires. Le pourcentage de cellules infectées, le nombre de parasites par cellule ou l'intensité du signal parasitaire se réduisent tous à un seul…
Certaines des questions les plus importantes en biologie cellulaire ne portent pas sur les cellules, mais sur ce qu'elles contiennent. Combien de mitochondries par cellule ? Combien de foci de dommages à l'ADN par noyau ? Combien de…
L'entrée de NF-κB dans le noyau est l'un des événements les plus étudiés en biologie de l'inflammation. La navette de YAP/TAZ est la lecture de la voie Hippo, essentielle dans le cancer et…
Un médicament est inutile s'il ne peut pas pénétrer dans la cellule. C'est le défi central des nanoparticules lipidiques, des peptides pénétrant les cellules, des conjugués anticorps-médicament et de l'ARN…
En 1882, Élie Metchnikoff enfonça une épine de rose dans une larve d'étoile de mer et observa des cellules affluer pour l'engloutir. Cette observation, des cellules qui dévorent des objets étrangers, est devenue l'un des fondements… Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=ezaikU7ix1I
Le criblage de médicaments en oncologie est itératif par nature. Les composés sont testés, affinés, puis testés à nouveau. L'équipe qui récupère les données de prolifération le jour même lance l'itération suivante…
Personne ne publie d'article sur l'efficacité de la transfection. Personne ne décroche de subvention pour cela. Pourtant, chaque expérience CRISPR, chaque étude de surexpression, chaque production de vecteur viral…
L'analyse du cycle cellulaire est essentielle pour comprendre la prolifération et les maladies. Alors que les méthodes à haut débit sacrifient l'information spatiale, Cytely permet une classification rapide des phases du cycle cellulaire à l'aide d'un simple marquage nucléaire et d'un profilage morphologique, tout en préservant le contexte spatial et en permettant une quantification reproductible.
La microscopie intelligente transforme les sciences du vivant en automatisant les flux de travail d'imagerie expérimentale et en permettant une adaptation en temps réel fondée sur le retour des images et d'autres flux de données. Cette évolution augmente le débit, améliore la reproductibilité et étend les capacités fonctionnelles des microscopes
L'analyse des populations cellulaires dans le sang total est une tâche fondamentale mais complexe. Même après les étapes de préparation standard, les échantillons contiennent souvent des populations mixtes de leucocytes, de plaquettes et d'érythrocytes (RBC). Cytely permet aux chercheurs d'identifier et de quantifier rapidement ces populations à l'échelle de la cellule unique. Grâce aux nuages de points et à un gating intuitif, différents types de cellules sanguines peuvent être distingués et caractérisés dans un flux de travail impartial et interactif. Principales fonctionnalités présentées dans cette note : Visualisation de l'hétérogénéité au sein d'une population cellulaire mixte Identification des populations (neutrophiles, plaquettes, RBC) à l'aide de nuages de points Gating pour isoler les sous-populations de neutrophiles
Découvrez comment analyser des expériences de phagocytose avec Cytely.
Nous examinons ici un simple échantillon de sang marqué pour les noyaux, le cytosol et la membrane. Nous avons facilement exclu par gating les érythrocytes et les plaquettes en raison de leur absence de signal nucléaire et de leur plus petite taille, tandis que les neutrophiles se sont distingués par leur fort marquage nucléaire et cytosolique. Habituellement, il faudrait plusieurs anticorps ou une lyse des érythrocytes pour parvenir à cette séparation, mais avec Cytely, vous pouvez le faire dans un seul flux de travail, en préservant le contexte spatial de votre échantillon et en réalisant l'analyse complète en quelques minutes.
En microscopie, le passage de l'observation qualitative aux données quantitatives constitue un défi majeur. L'analyse manuelle est sujette au biais de l'utilisateur et s'avère impraticable pour les grands jeux de données, tandis que de nombreuses solutions automatisées peuvent masquer le lien entre les données quantitatives et le contexte visuel d'origine. Cytely est un outil web conçu pour relever ces défis en intégrant la segmentation automatisée des images à l'exploration interactive des données. Il offre un flux de travail structuré permettant de dériver des métriques quantitatives à partir de populations cellulaires et de relier ces métriques à leurs images sources en temps réel.
Les plateformes de microscopie contemporaines génèrent des jeux de données d'une ampleur considérable, capturant couramment 10 000 à 100 000 cellules par condition expérimentale. Cependant, les contraintes analytiques limitent fréquemment la quantification à de petits sous-ensembles, généralement 100 à 1 000 cellules, représentant moins de 1 % des données disponibles. Ce sous-échantillonnage systématique introduit un biais de sélection, réduit la puissance statistique et masque l'hétérogénéité des populations. Nous examinons les conséquences méthodologiques d'une exploitation incomplète des données et présentons l'analyse automatisée à haut contenu comme une solution à l'écart entre la capacité d'acquisition des données et le débit analytique.
La microscopie de fluorescence contemporaine génère des données d'imagerie à haute résolution qui restent largement sous-exploitées en raison des goulets d'étranglement analytiques dans les flux de travail de quantification. Alors que la cytométrie en flux a établi des normes rigoureuses pour l'analyse de cellules uniques à l'échelle de la population, les approches basées sur la microscopie reposent généralement sur le dénombrement manuel d'échantillons de taille limitée, ce qui restreint la puissance statistique et masque l'hétérogénéité des populations. Cette perspective plaide en faveur de l'application systématique des principes cytométriques à l'analyse basée sur l'image, permettant aux chercheurs de tirer parti des avantages spatiaux et morphologiques de la microscopie tout en atteignant la rigueur statistique caractéristique des méthodologies basées sur le flux.