Il ne s'agit pas d'un test unique, mais de la capacité qui alimente la moitié de la biologie cellulaire moderne. Foci γH2AX. Points RNAscope. Puncta PLA. Granules de stress. Corps P. Corps PML. Cellules pathogènes.… Découvrez l'analyse en action : https://youtube.com/watch?v=Kdvpba7jLF0
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Il ne s'agit pas d'un test unique, mais de la capacité qui alimente la moitié de la biologie cellulaire moderne. Foci γH2AX. Points RNAscope. Puncta PLA. Granules de stress. Corps P. Corps PML. Cellules pathogènes. Gouttelettes lipidiques. Puncta synaptiques. Agrégats de médicaments. Tous relèvent du même problème analytique : de petits objets brillants à l'intérieur des cellules, qu'il faut détecter, compter et mesurer par cellule.
La version manuelle, un chercheur plissant les yeux devant ses images, cliquant sur des points et reportant les comptages dans un tableur, est l'une des tâches les plus chronophages de la recherche biologique. Une seule expérience de dommages à l'ADN peut exiger de compter les foci dans plus de 200 noyaux. Une expérience RNAscope multiplie ce chiffre par le nombre de canaux de sondes.
Le moteur de détection de spots de Cytely est le socle commun de tous ces tests. Il détecte les puncta, mesure leur nombre, leur surface et leur intensité par cellule, et intègre ces mesures dans la même interface de fenêtrage interactif et de lien avec l'image que toutes les autres analyses Cytely.
Déroulement du test
Segmenter les noyaux/cellules à partir du DAPI → détecter les puncta dans le canal cible → compter et mesurer par cellule.
Ce que vous fournissez
- Ch1 : DAPI
- Ch2 : canal contenant les structures ponctuées (IF, sonde FISH ou étiquette fluorescente)
Ce que vous obtenez
- Nombre de spots par cellule
- Surface totale des spots par cellule
- % de cellules présentant des spots
- Mesures par spot (surface
- Intensité moyenne/médiane/min/max
- Intensité intégrée (somme)
- Circularité
- Élongation (rapport grand axe/petit axe), orientation, position du centroïde)
Prêt à l'emploi
Foci de dommages à l'ADN (γH2AX, 53BP1, RAD51), puncta d'ARN (RNAscope, smFISH), granules de stress (G3BP1), P-bodies (DCP1A), corps PML, puncta synaptiques, clusters de récepteurs, agrégats de médicaments, particules virales, gouttelettes lipidiques, toute structure ponctuée subcellulaire.
Sur demande
Détection de spots en 3D dans des piles Z, suivi des spots au cours du temps.