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La plupart des chercheurs acquièrent des images de microscopie, puis décrivent ce qu'ils voient avec des adjectifs : les cellules semblent plus grandes, elles paraissent plus arrondies après traitement.

Ce sont de vraies observations. La morphologie est l'un des indicateurs les plus précoces et les plus sensibles de l'effet d'un médicament, de la toxicité et de la différenciation. Mais les adjectifs ne se prêtent pas à un test statistique.

Cytely extrait la surface, la circularité, l'élongation, le périmètre et l'intensité multicanal de chaque cellule. Il transforme l'intuition visuelle en chiffres, et les chiffres en populations fenêtrables. Les cellules qui « ont l'air différentes » deviennent un groupe défini sur un nuage de points, que vous pouvez quantifier, comparer entre conditions et reproduire.

La morphologie est la mesure la moins coûteuse et la plus riche en information disponible en criblage phénotypique. Elle ne nécessite aucun réactif particulier au-delà d'un marquage nucléaire et d'un marqueur du corps cellulaire. La phénomique pilotée par l'IA est l'un des domaines qui progressent le plus vite dans la découverte de médicaments, et elle commence par une extraction fiable de la morphologie cellule par cellule.

Déroulement du test

Segmenter les noyaux à partir du DAPI → éventuellement les étendre pour approximer la frontière cellulaire ou utiliser un second canal pour la segmentation du corps cellulaire → mesurer les caractéristiques morphologiques et d'intensité par cellule sur tous les canaux → explorer et fenêtrer de manière interactive à l'aide de nuages de points 2D.

Ce que vous fournissez

  • Ch1 : DAPI (marquage nucléaire)
  • Ch2-4 : marquage du corps cellulaire, marqueur du cytosquelette ou canaux de protéines d'intérêt (IF ou étiquettes fluorescentes)

Ce que vous obtenez

  • Surface
  • Circularité
  • Élongation (rapport grand axe/petit axe)
  • Périmètre par cellule
  • Intensité moyenne/médiane/min/max par canal

Prêt à l'emploi

Morphologie nucléaire seule, morphologie de la cellule entière (avec marquage du corps cellulaire), profilage d'intensité multicanal (jusqu'à 4 canaux), segmentation cellulaire en fond clair, fenêtrage interactif de population pour la classification des types cellulaires, tests d'étalement cellulaire / d'étalement sur substrat (phalloïdine/F-actine), morphométrie de l'étalement plaquettaire.

Sur demande

Caractéristiques de texture (Haralick), classificateurs de phénotype basés sur l'apprentissage automatique, plongements (embeddings) de forme cellulaire.

Découvrir le test Morphologie cellulaire et profilage phénotypique →