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L'analyse de colocalisation souffre d'un problème de réputation. Pendant des années, la pratique courante consistait à fusionner les canaux rouge et vert, à chercher du jaune et à déclarer une colocalisation. Cette approche est subjective, sensible à la luminosité de l'image et produit régulièrement des résultats trompeurs. Les relecteurs le savent. Les éditeurs le savent. Et pourtant, elle persiste, parce que bien faire les choses, c'est-à-dire calculer les coefficients de Pearson et de Manders par cellule, exige des outils que la plupart des chercheurs de paillasse n'ont pas mis en place.

Cytely calcule la corrélation de Pearson ou les coefficients de chevauchement de Manders M1/M2 au sein de chaque cellule, et non par image. Cela change tout : un coefficient par image fait la moyenne de toutes les cellules et masque le fait que certaines présentent une forte colocalisation et d'autres aucune. Les coefficients par cellule vous donnent une distribution, c'est-à-dire la biologie réelle.

Et si vous avez besoin de plus de spécificité, vous pouvez restreindre l'analyse à un compartiment précis (noyau uniquement ou cytoplasme uniquement).

L'engagement de la cible, qui consiste à prouver qu'un médicament atteint sa cible intracellulaire, repose souvent sur la colocalisation d'un composé marqué avec un marqueur de la cible. Les images subjectives de « fusion jaune » ne résistent pas à l'examen réglementaire. Les coefficients de Pearson par cellule, vérifiables sur l'image, si.

Déroulement du test

Segmenter les cellules → calculer la corrélation de Pearson et les coefficients de Manders entre les canaux Ch2 et Ch3 au sein de chaque cellule. Restreindre éventuellement l'analyse à un compartiment spécifique (noyau seul ou cytoplasme seul).

Ce que vous fournissez

  • Ch1 : DAPI
  • Ch2 : marqueur A (IF ou étiquette fluorescente)
  • Ch3 : marqueur B (IF ou étiquette fluorescente)

Ce que vous obtenez

  • Coefficient de corrélation de Pearson par cellule
  • Coefficients de chevauchement de Manders M1/M2 par cellule
  • % de cellules présentant une colocalisation positive
  • Rapports d'intensité entre canaux par cellule

Prêt à l'emploi

Colocalisation récepteur-ligand (par exemple EGFR + EGF), sites de contact entre organites (par exemple mitochondrie-RE via MitoTracker + ER-Tracker), co-activation de voies (par exemple phospho-protéine + protéine totale), localisation d'accumulation de médicament (par exemple composé + marqueur lysosomal), colocalisation spécifique de compartiment (noyau seul, cytoplasme seul).

Sur demande

Colocalisation basée sur les objets (évaluation du chevauchement spatial spot-à-spot), analyse de fonction de corrélation croisée, colocalisation en 3D.

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