L'entrée de NF-κB dans le noyau est l'un des événements les plus étudiés en biologie de l'inflammation. La navette de YAP/TAZ est la mesure de référence de la voie Hippo, essentielle dans le cancer et la régénération. La translocation de FOXO renseigne sur la signalisation de l'insuline. Ce sont parmi les mesures de voies de signalisation les plus courantes en découverte de médicaments, et elles se résument toutes à un seul chiffre : le rapport d'intensité nucléo-cytoplasmique.

La difficulté technique consiste à définir où mesurer les intensités. Il faut d'abord un masque du noyau (à partir du DAPI), puis un masque cytoplasmique, puis des mesures d'intensité dans les deux régions. C'est faisable avec des outils généralistes, mais cela demande de la configuration, des scripts ou la construction d'un pipeline pour chaque nouvelle expérience.

Cytely automatise la génération des masques : segmenter les noyaux et le cytoplasme, soustraire les noyaux, mesurer l'intensité du canal cible dans les deux compartiments, calculer le rapport. Le résultat est un rapport N/C par cellule que vous pouvez représenter en fonction de la dose pour construire des courbes de translocation.

Déroulement du test

Segmenter les noyaux à partir du DAPI → dilater pour approximer la frontière cellulaire → soustraire les noyaux pour créer un anneau cytoplasmique → mesurer l'intensité du canal cible dans les deux compartiments → calculer le rapport.

Ce que vous fournissez

  • Ch1 : DAPI (marquage nucléaire)
  • Ch2 : protéine cible (IF ou étiquette fluorescente)

Ce que vous obtenez

  • Rapport d'intensité nucléo-cytoplasmique (rapport N/C) par cellule
  • % de cellules présentant une translocation par condition

Prêt à l'emploi

YAP, NF-κB, FOXO, p65, STAT3, toute protéine à navette nucléo-cytoplasmique.

Sur demande

Translocation spécifique aux organites (par exemple RE-vers-Golgi).

Découvrir le test Translocation nucléaire →