Certaines des questions les plus importantes en biologie cellulaire ne portent pas sur les cellules elles-mêmes, mais sur ce qu'elles contiennent. Combien de mitochondries par cellule ? Combien de foci de dommages à l'ADN par noyau ? Combien de lobes dans le noyau d'un neutrophile ? La biologie varie, mais le problème analytique reste le même : des objets dans des objets, comptés et rattachés à leur parent.

La difficulté est hiérarchique. Les flux de travail traditionnels gèrent proprement un niveau de segmentation. Deux niveaux, avec des efforts. Trois niveaux avec des relations parent-enfant intactes, c'est là que la plupart des outils atteignent leurs limites. Les chercheurs simplifient alors la question ou passent des jours à écrire des scripts sur mesure pour reconnecter ce que l'analyse a déconnecté.

Cytely gère nativement cette hiérarchie. Segmentez les cellules à partir d'un canal, les sous-structures à partir d'un autre. Les relations parent-enfant sont automatiques. Chaque objet conserve sa filiation. Le nombre d'enfants, la surface totale des enfants et l'intensité moyenne des enfants deviennent des mesures standard, disponibles pour le fenêtrage et la représentation graphique comme n'importe quelle autre caractéristique.

Le résultat : une résolution à l'échelle de la cellule unique sur les questions qui comptent. Non pas « quel est le nombre moyen de foci dans le puits », mais « montrez-moi la distribution des foci par cellule et laissez-moi fenêtrer sur les forts répondeurs ». C'est toute la différence entre le flou d'une moyenne de population et une véritable compréhension biologique.

Déroulement du test

Segmenter les objets parents (par exemple les cellules) → détecter les sous-objets à l'intérieur de chaque parent → mesurer le nombre, la surface, l'intensité et la circularité des sous-objets par parent.

Ce que vous fournissez

  • Ch1 : DAPI
  • Ch2 : canal des objets parents (par exemple marquage du corps cellulaire)
  • Ch3 : canal des sous-objets (par exemple marqueur d'organite)

Ce que vous obtenez

  • Nombre de sous-objets par parent
  • Surface totale des sous-objets par parent
  • Intensité moyenne des sous-objets
  • Distribution des tailles des sous-objets

Prêt à l'emploi

Organites par cellule (fragments mitochondriaux, lysosomes, endosomes), inclusions par noyau (speckles nucléaires, corps de Cajal), vésicules par compartiment (vésicules de sécrétion, vésicules d'endocytose), doubles ensembles de sous-objets par parent (par exemple deux types d'organites avec ratios de nombre).

Sur demande

Suivi de sous-objets au cours du temps, relations spatiales sous-objet à sous-objet au sein d'un parent.

Découvrir le test Quantification de sous-objets →