リソソームは、神経変性、リソソーム蓄積症、mTORシグナル伝達、そして急速に拡大しているオートファジー調節薬のパイプラインの中心に位置しています。解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=FHkNHhXVEsg

マルチプレックスイメージングの華やかな最先端は見出しを飾ります。CODEX、MIBI、IMC。一度に40以上のマーカー。これらは本物で重要ですが、ほとんどの生物学研究が行われている方法ではありません。解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=UDzyReIdr-4

フォーサイのカウントは、単一チャネルの問題として扱われがちです。1つのマーカー、1つの条件、細胞ごとのカウント。それは問いの一部にしか答えていません。解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=isTnJ2ngjQA

20世紀のほとんどの期間、脂質滴は貯蔵された脂肪の不活性な塊として扱われてきました。その見方は、ペリリピンの発見とともに、ミレニアムの変わり目頃に覆されました… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=k9OP8MAwC2k

宿主細胞内の寄生虫を数えることは、抗寄生虫薬の創薬における中核的な読み出しです。感染細胞の割合、細胞あたりの寄生虫数、寄生虫シグナル強度は、いずれも一つの… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=1QrqcxTw4m4

細胞生物学における最も重要な問いのいくつかは、細胞そのものについてではなく、細胞の中に何があるかについてです。細胞あたりのミトコンドリアはいくつか？核あたりのDNA損傷フォーサイはいくつか？いくつの… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=8mtTu3NOQsQ

NF-κBの核内への移行は、炎症生物学において最もよく研究されている事象の一つです。YAP/TAZのシャトリングはHippo経路の読み出しであり、がんなどにおいて極めて重要です… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=kDdKmLDTt1U

薬剤は細胞内に入れなければ役に立ちません。これは、脂質ナノ粒子、細胞膜透過ペプチド、抗体薬物複合体、そしてRNAにとって中心的な課題です… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=1qo3xSGYcl8

腫瘍学（オンコロジー）の創薬スクリーニングは、本質的に反復的です。化合物はテストされ、改良され、再テストされます。増殖データを当日中に受け取れるチームが、次の反復サイクルを回すことができます… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=cnusK8DL80Y

トランスフェクション効率について論文を発表する人はいません。それで助成金を獲得する人もいません。しかし、あらゆるCRISPR実験、あらゆる過剰発現研究、あらゆるウイルスベクター産生の実行が… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=EuR_Mkd1BhI

細胞周期の解析は、増殖と疾患を理解する上で極めて重要です。ハイスループットな手法では空間情報が犠牲になりますが、Cytelyを使えば、核染色のみと形態プロファイリングによって細胞周期の各段階を迅速に分類でき、空間的コンテキストを保持しながら再現性のある定量が可能になります。

スマート顕微鏡は、実験的なイメージングワークフローを自動化し、画像やその他のデータストリームからのフィードバックに基づくリアルタイムの適応を可能にすることで、ライフサイエンスを変革しています。この変化により、スループットが向上し、再現性が高まり、顕微鏡の機能的な能力が拡張されます。

全血中の細胞集団を解析することは、基本的でありながら困難な作業です。標準的な調製手順を経た後でも、サンプルには白血球・血小板・赤血球（RBC）が混在した集団が含まれていることがよくあります。Cytelyを使えば、研究者はこれらの集団を単一細胞レベルで迅速に特定・定量できます。散布図と直感的なゲーティングを通じて、さまざまな血液細胞タイプを、バイアスのないインタラクティブなワークフローで区別・特性評価できます。 本ノートで示す主な機能： 混在する細胞集団全体における不均一性の可視化 散布図を用いた集団（好中球・血小板・RBC）の特定 ゲーティングによる好中球サブセットの単離

Cytelyで貪食（ファゴサイトーシス）実験を解析する方法をご紹介します。チュートリアルはこちら：https://www.youtube.com/watch?v=sb6qlD4Cl4E

ここでは、核・細胞質・細胞膜を染色した基本的な血液サンプルを見ていきます。核シグナルの欠如とサイズの小ささからRBCと血小板を簡単にゲーティングして除外し、一方で好中球は強い核染色と細胞質染色によってはっきりと浮かび上がりました。通常、この分離を実現するには複数の抗体やRBC溶解が必要ですが、Cytelyを使えば単一のワークフローでこれを行うことができ、サンプルの空間的コンテキストを保持しながら、解析全体をわずか数分で完了できます。

顕微鏡観察において、定性的な観察から定量的なデータへの移行は大きな課題です。手動での解析はユーザーのバイアスを受けやすく、大規模なデータセットには実用的ではありません。一方、多くの自動化ソリューションでは、定量データと元の視覚的コンテキストとのつながりが見えにくくなってしまいます。 Cytelyは、自動画像セグメンテーションとインタラクティブなデータ探索を統合することで、これらの課題に取り組むために設計されたWebベースのツールです。細胞集団から定量的な指標を導き出し、それらの指標をソース画像とリアルタイムで結び付ける、体系的なワークフローを提供します。

現代の顕微鏡プラットフォームは相当な規模のデータセットを生成し、実験条件あたり10,000〜100,000細胞を日常的に取得します。しかし、解析上の制約により、定量はしばしば小さなサブセット（通常100〜1,000細胞）に限られ、これは利用可能なデータの1%未満に相当します。この体系的なアンダーサンプリングは選択バイアスを生み、統計的検出力を低下させ、集団の不均一性を見えにくくします。本稿では、不完全なデータ活用がもたらす方法論的な帰結を検討し、データ取得能力と解析スループットの乖離に対する解決策として、自動化されたハイコンテント解析を提示します。

現代の蛍光顕微鏡は高解像度のイメージングデータを生成しますが、定量ワークフローにおける解析上のボトルネックのために、そのデータは大部分が十分に活用されていません。フローサイトメトリーが集団レベルの単一細胞解析に厳密な標準を確立してきた一方で、顕微鏡ベースの手法は限られたサンプルサイズの手動計数に依存するのが一般的であり、統計的検出力を制約し、集団の不均一性を見えにくくしています。本稿では、サイトメトリーの原則を画像ベースの解析に体系的に適用することを提唱します。これにより研究者は、顕微鏡の空間的・形態的な利点を活用しながら、フローベースの手法に特徴的な統計的厳密さを達成できます。