これは単一のアッセイではありません。現代の細胞生物学の半分を支える機能です。γH2AXフォーサイ、RNAscopeドット、PLA斑点、ストレス顆粒、Pボディ、PMLボディ、病原体細胞… 解析の実際の様子はこちら：https://youtube.com/watch?v=Kdvpba7jLF0
これは単一のアッセイではありません。現代の細胞生物学の半分を支える機能です。γH2AXフォーサイ、RNAscopeドット、PLA斑点、ストレス顆粒、Pボディ、PMLボディ、病原体細胞、脂肪滴、シナプス斑点、薬剤凝集体。これらはすべて同じ解析上の課題、つまり細胞内の小さく明るいオブジェクトを検出し、カウントし、細胞ごとに測定するという課題です。
研究者が画像に目を凝らし、ドットをクリックし、スプレッドシートにカウントを記録するという手作業は、生物学研究で最もよくある時間の浪費の一つです。1回のDNA損傷実験で200個以上の核のフォーサイをカウントしなければならないこともあります。RNAscope実験では、それがプローブチャネルの数だけ倍増します。
Cytelyのスポット検出エンジンは、これらすべてのアッセイに共通する基盤です。斑点を検出し、細胞ごとの数、面積、強度を測定し、それらの測定値を、Cytelyの他のすべての解析を支えるのと同じインタラクティブなゲーティングおよび画像リンクのインターフェースに送ります。
アッセイの実行方法
DAPIから核/細胞をセグメンテーション → 標的チャネルで斑点を検出 → 細胞ごとに計数し測定。
ご用意いただくもの
- Ch1: DAPI
- Ch2: 斑点状構造を含むチャネル（IF、FISHプローブ、または蛍光タグ）
得られるもの
- 細胞ごとのスポット数
- 細胞ごとのスポット総面積
- スポットを持つ細胞の割合（%）
- スポットごとの測定値（面積
- 平均/中央値/最小/最大強度
- 積算（合計）強度
- 円形度
- 伸長度（長軸/短軸比）、向き、重心位置）
すぐに実行可能
DNA損傷フォーサイ(γH2AX、53BP1、RAD51)、RNA斑点(RNAscope、smFISH)、ストレス顆粒(G3BP1)、P-body(DCP1A)、PML body、シナプス斑点、受容体クラスター、薬物凝集体、ウイルス粒子、脂肪滴、任意の細胞内斑点状構造。
サポートについてはお問い合わせください
Zスタックでの3次元スポット検出、経時的なスポットトラッキング。