タンパク質共局在・共発現
各細胞内のピクセルレベルの相関を用いて、2つのタンパク質またはマーカーが同一の細胞領域を占めるかどうかを判定します。受容体-リガンド相互作用、オルガネラ接触部位、経路の共活性化、薬物標的の関与評価に用います。
- Ch1: DAPI
- Ch2: marker A (IF or fluorescent tag)
- Ch3: marker B (IF or fluorescent tag)
- Pearson correlation coefficient per cell
- Manders M1/M2 overlap coefficients per cell
- % cells with positive colocalization
- Channel intensity ratios per cell
タンパク質共局在・共発現に必要なすべてが揃っています
クラウドで完結する、自動化された再現性の高いノーコード解析
クラウドベース
インストール不要、GPU不要。あらゆるデバイスのブラウザから解析を実行できます。
完全自動化
画像をアップロードするだけで、論文に使える結果が得られます。コーディングやスクリプトは不要です。
再現性
すべての解析は記録され、再現可能です。プロトコルを共同研究者と即座に共有できます。
解析の流れ
Cytelyが画像解析を自動化するので、研究に集中できます。
細胞をセグメンテーション
各細胞内でCh2とCh3の間のPearson相関とManders係数を計算。任意で解析を特定のコンパートメント(核のみまたは細胞質のみ)に限定。
対応状況
すぐに実行可能
受容体-リガンド共局在(例: EGFR + EGF)、オルガネラ接触部位(例: MitoTracker + ER-Trackerによるミトコンドリア-小胞体)、経路の共活性化(例: リン酸化タンパク質 + 総タンパク質)、薬物蓄積の局在(例: 化合物 + リソソームマーカー)、コンパートメント特異的共局在(核のみ、細胞質のみ)。
サポートについてお問い合わせください
オブジェクトベースの共局在(スポット間の空間的重なりのスコア化)、相互相関関数解析、3次元共局在。
1 サンプルの品質に依存します
タンパク質共局在・共発現解析を自動化する準備はできていますか？
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バイアスを完全に排除できます。画像解析にかかる時間を考えれば、コストはごくわずかです。
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Cytely を使えば、数千個の細胞を瞬時に解析し、どの細胞がトランスフェクションされたのか、感染したのか、あるいはその両方なのかを正確に特定できました。3年間行き詰まっていた課題が、最初のセッションで解決したのです。
