Conjuntos de datos
Una colección seleccionada de análisis de células individuales. Abra cualquier conjunto de datos directamente en Cytely para explorar la metodología, las imágenes y los resultados.
DNA Damage & Genotoxicity - Foci Counting per Nucleus
Células expuestas a dos concentraciones de un agente genotóxico y teñidas para núcleos y focos de daño en el ADN. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo contar los focos de daño por núcleo, excluir agregados mediante gating por la forma nuclear y comparar el número medio de focos entre grupos de tratamiento. El número de focos por núcleo aumenta con la concentración del agente genotóxico.
Tissue Cellularity Quantification - Nuclei Counting in Tissue Sections
Secciones de tejido humano teñidas con hematoxilina procedentes del Human Protein Atlas. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo contar núcleos y células en secciones de tejido completas e informar la celularidad por región. Cada objeto detectado conserva su posición en la sección, de modo que las regiones de interés pueden delimitarse directamente sobre el mapa del tejido y compararse por área, perímetro y circularidad.
Protein Co-localization - Salmonella and ER Membrane
Células HeLa infectadas con Salmonella enterica marcada con mCherry y teñidas con un colorante ER-tracker, adquiridas mediante microscopía confocal de alto contenido. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo cuantificar la colocalización entre las bacterias intracelulares y el retículo endoplásmico del huésped, comparando cepas de tipo salvaje y mutantes isogénicas ΔsifA.
Bacteria Internalization - Salmonella Infected HeLa Cells
Células HeLa infectadas con Salmonella enterica marcada con mCherry, adquiridas mediante microscopía confocal de alto contenido. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo detectar y cuantificar bacterias intracelulares a nivel de una sola célula, comparando el número de bacterias por célula huésped entre diferentes concentraciones de patógeno.
Cell Morphology - Pluripotent Stem Cell Differentiation States
Un conjunto de datos de imágenes de alto contenido multicanal de células madre pluripotentes humanas. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo explorar y distinguir subpoblaciones celulares por su morfología con Cytely: segmentando núcleos y citoplasma, midiendo características morfológicas e intensidad de señal, y utilizando la selección morfológica para aislar y comparar estados de diferenciación distintos.
Spot & Foci Detection - Intracellular Sub-Object Counting
Un conjunto de datos de imágenes de alto contenido multicanal para la detección de spots y focos intracelulares. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo detectar y cuantificar subobjetos intracelulares a nivel de una sola célula con Cytely, comparando el número de subobjetos por célula entre diferentes condiciones experimentales.
Lysosomal pH Activity in FaDu and HGFb Cells
Una adquisición confocal de 4 canales de células FaDu y HGFb tratadas con moduladores de la autofagia. Los autofagosomas portan un marcaje en tándem TagRFP/Emerald-GFP (la GFP se apaga por debajo de pH 6 mientras que TagRFP permanece estable) y los lisosomas se marcan con LysoTracker, lo que proporciona una lectura ratiométrica de la acidez. Cytely segmenta los lisosomas e informa el número de lisosomas por célula en los distintos grupos de tratamiento farmacológico, incluidos Bafilomicina y BEZ.
Multiplex Imaging Analysis
Una adquisición Cell Painting de 5 canales de células humanas U2OS procedente de un cribado de perfilado de compuestos de ~1.600 compuestos bioactivos. Cytely segmenta núcleos, citoplasma, nucléolos, puncta de concanavalina A y mitocondrias, y luego informa la morfología por célula y los recuentos de objetos en los distintos grupos de tratamiento con moléculas pequeñas.
Multi-Marker Foci Association
Una adquisición multicanal para detectar múltiples marcadores de foci de daño en el ADN a nivel unicelular. Cytely segmenta los núcleos, detecta los foci en los distintos canales e informa el recuento, la intensidad y el área de foci por célula en células expuestas a un agente que daña el ADN.
Sub-Object Quantification Example
Una adquisición de 3 canales (DAPI, FITC, CY5). Cytely segmenta las células padre y detecta objetos más pequeños dentro de ellas, informando el recuento de hijos y el área total de hijos por padre junto con la morfología del padre.
Leishmania Infection of Macrophages
Una adquisición de 2 canales de macrófagos derivados de médula ósea infectados con Leishmania major. Cytely segmenta las células hospedadoras y detecta los parásitos intracelulares como subobjetos, informando el número de parásitos por célula hospedadora. Fuente: Juez et al., figshare 2023.
Nuclear Translocation Benchmark (BBBC014v1)
Una adquisición de 2 canales (contratinción nuclear DAPI + señal NF-κB con FITC) del benchmark BBBC014: translocación citoplasma-núcleo del factor de transcripción NF-κB en células MCF7 y A549 en respuesta a TNF-α. Cytely segmenta los núcleos y el citoplasma circundante e informa la relación de intensidad nuclear/citoplasmática de NF-κB por célula, que aumenta de forma dependiente de la dosis con TNF-α.
Lipid Droplet Accumulation
Una adquisición de 3 canales procedente de un cribado de reposicionamiento de fármacos por fosfolipidosis. Cytely segmenta las células y detecta las gotas lipídicas como subobjetos, informando el recuento de gotas por célula, el área media de las gotas y el área total de las gotas. Fuente: Kuzikov et al., Patterns 2026 (idr0171).
Spot Uptake in Cells
Una adquisición de 3 canales procesada con un pipeline de doble subobjeto: los núcleos celulares se segmentan como objetos padre, los spots/picos se detectan como hijos y se asocian a sus células hospedadoras. La lectura principal es el número de hijos detectados (spots) por célula. Fuente: Rees et al., Nature Communications 2019 (S-BSST249).
Cell Cycle Arrest in Breast Cancer Cells
Una adquisición de 4 canales (Hoechst, Phospho-Rb, p21, EdU) de células de cáncer de mama. Cytely segmenta los núcleos a partir de Hoechst y mide la intensidad por núcleo en los cuatro canales, generando una lectura por célula para la población positiva para EdU (fase S). Fuente: Weston et al., Sci Data 2024 (S-BIAD1013).
THP-1 Phagocytosis Assay
Células THP-1 teñidas con aglutinina de germen de trigo (naranja) y DAPI (azul) que han fagocitado microesferas fluorescentes (verde) opsonizadas por anticuerpos. Este conjunto de datos muestra las capacidades del ensayo de fagocitosis de Cytely para medir la captación de partículas por células inmunitarias.
Transfection Efficiency - Actin and Integrin Double Transfection
Células HeLa transfectadas con plásmidos de integrina (naranja/TRITC) y actina (rojo/Cy5), con tinción nuclear adicional DAPI (azul) y tinción de membrana con aglutinina de germen de trigo (verde/FITC). Este conjunto de datos demuestra cómo determinar la eficiencia de transfección tanto para transfecciones de un solo plásmido como de doble plásmido. Muestra una eficiencia de transfección relativamente baja, lo que resalta el valor de Cytely para la optimización de métodos.
Cell Cycle Analysis - Mitotic Cells in HeLa Cultures
Clasificación de las etapas del ciclo celular en células HeLa mediante análisis basado en la morfología utilizando únicamente tinción nuclear estándar. Este conjunto de datos demuestra la identificación de las fases del ciclo celular (G0/G1, S/G2, M) usando la morfología nuclear sin colorantes especializados. Se aislaron con éxito 164 células mitóticas (3 %) de ~5.500 células totales mediante gating secuencial basado en características nucleares.
Blood Cell Analysis - Neutrophils
Análisis de poblaciones celulares en muestras de sangre completa que contienen poblaciones mixtas de leucocitos, plaquetas y glóbulos rojos (GR). Este conjunto de datos demuestra la identificación y cuantificación rápidas de distintos tipos de células sanguíneas a nivel unicelular mediante gráficos de dispersión y gating intuitivo. Identifica con éxito neutrófilos (57 %), plaquetas (11 %) y GR (12 %) a partir de una muestra heterogénea.
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