DNA Damage & Genotoxicity - Foci Counting per Nucleus
Células expuestas a dos concentraciones de un agente genotóxico y teñidas para núcleos y focos de daño en el ADN. Este conjunto de datos de ejemplo muestra cómo contar los focos de daño por núcleo, excluir agregados mediante gating por la forma nuclear y comparar el número medio de focos entre grupos de tratamiento. El número de focos por núcleo aumenta con la concentración del agente genotóxico.
Véalo en acción
Vea cómo se analizó este conjunto de datos de principio a fin en Cytely.
Metodología
Imágenes de fluorescencia de dos canales de núcleos y focos de daño en el ADN de células tratadas con dos concentraciones de un agente genotóxico. Los núcleos se segmentan con Segment Cell Nuclei y se limpian con Fill Holes. Los focos se realzan con un filtro paso alto FFT y se segmentan con Overlapping Background Segmentation; un sembrador de picos seguido de flood fill separa los focos adyacentes que comparten etiqueta. Associate Objects y Join Sub Objects asignan los focos a su núcleo principal y los cuentan. En los resultados, un gráfico de área frente a perímetro nuclear sirve para excluir agregados mediante gating, un gráfico de puntos muestra los focos por núcleo y un gráfico de barras compara el número medio de focos por grupo de células.
Atribución
Images provided by Aris Polyzos at Lawrence Berkeley National Laboratory.
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