Colocalización y coexpresión de proteínas
Determina si dos proteínas o marcadores ocupan las mismas regiones celulares, utilizando la correlación a nivel de píxel dentro de cada célula. Se utiliza para evaluar las interacciones receptor-ligando, los sitios de contacto entre orgánulos, la coactivación de vías y la interacción con dianas farmacológicas.
- Ch1: DAPI
- Ch2: marker A (IF or fluorescent tag)
- Ch3: marker B (IF or fluorescent tag)
- Pearson correlation coefficient per cell
- Manders M1/M2 overlap coefficients per cell
- % cells with positive colocalization
- Channel intensity ratios per cell
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Cómo funciona
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Segmentar las células
Calcular la correlación de Pearson y los coeficientes de Manders entre Ch2 y Ch3 dentro de cada célula. Opcionalmente, restringir el análisis a un compartimento específico (solo núcleo o solo citoplasma).
Compatibilidad
Listo para ejecutar1
Colocalización receptor-ligando (p. ej., EGFR + EGF), sitios de contacto entre orgánulos (p. ej., mitocondria-RE mediante MitoTracker + ER-Tracker), coactivación de vías (p. ej., fosfoproteína + proteína total), localización de la acumulación de fármaco (p. ej., compuesto + marcador lisosomal), colocalización específica de compartimento (solo nuclear, solo citoplasmática).
Consultar disponibilidad
Colocalización basada en objetos (evaluación del solapamiento espacial punto a punto), análisis de la función de correlación cruzada, colocalización en 3D.
1 Depende de la calidad de la muestra
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