Zellnähe- & Nachbarschaftsanalyse
Nutzt Zellkoordinaten und markerdefinierte Identitäten, um Nähe, Nachbarschaftszusammensetzung, Clusterbildung und Infiltration in Bildern zu quantifizieren.
- Ch1: DAPI, Hoechst, or hematoxylin
- Ch2-4: markers used to classify cell populations
- Optional annotated tissue boundary or region mask
- Nearest-neighbour distance by cell-type pair
- Number and composition of cells within a defined radius
- Homotypic and heterotypic clustering metrics
- Distance to tissue, tumour, or compartment boundary
- 2D infiltration depth and density by region
Alles, was Sie für Zellnähe- & Nachbarschaftsanalyse benötigen
Automatisierte, reproduzierbare und codefreie Analyse in der Cloud
Cloudbasiert
Keine zu installierende Software, keine GPU erforderlich. Führen Sie Analysen von jedem Browser auf jedem Gerät aus.
Vollständig automatisiert
Laden Sie Ihre Bilder hoch und erhalten Sie publikationsreife Ergebnisse. Keine Programmierung oder Skripterstellung erforderlich.
Reproduzierbar
Jede Analyse wird protokolliert und ist reproduzierbar. Teilen Sie Protokolle sofort mit Ihren Mitarbeitern.
So läuft es ab
Cytely automatisiert die Bildanalyse, damit Sie sich auf die Wissenschaft konzentrieren können.
Zellen segmentieren und klassifizieren
Schwerpunktkoordinaten beibehalten
Optional Geweberegionen oder -grenzen definieren
Paarweise Abstände und radiusbasierte Nachbarschaften berechnen
Nach Population und Bedingung zusammenfassen.
Kompatibilität
Einsatzbereit1
Tumor-Immun-Nähe, Clusterbildung von Immunzellen, Nachbarschaften in Mischkulturen, Analyse Kern gegenüber Randbereich, grundlegende Nischenzusammensetzung, Nähe markerpositiver Zellen in konventionellen Multiplex-Bildern.
Für Unterstützung anfragen
Full CODEX/PhenoCycler/IMC high-plex workflows, cyclic image registration, advanced graph-community inference, or 3D neighbourhood analysis. This proposal assumes coordinate-derived measurements can be exposed reliably in the product, volumetric 3D neighbourhood analysis.
1 Abhängig von der Probenqualität
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- Unterstützung bei der Bildanalyse
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Der datengetriebene Ansatz von Cytely ist ein Traum für erfahrene Mikroskopiker wie mich.
Das eliminiert jegliche Verzerrung vollständig. Der Preis ist verschwindend gering, wenn man bedenkt, wie viel Zeit die Bildanalyse sonst kostet.
Es ist einfach erstaunlich, was heute möglich ist! Cytely nimmt mir die ganze Arbeit ab!
Mit Cytely bin ich zehnmal schneller. Es spart bei jedem Experiment Stunden.
Die Erkenntnisse, die wir dank Cytely gewonnen haben, waren eine absolut transformative Erfahrung. Sie ermöglichten es uns, unser Experiment neu zu konzipieren und das Projekt endlich voranzubringen.
Cytely hat unsere Zeitpläne drastisch verkürzt und zugleich die Zuverlässigkeit der Daten erhöht – durch automatisierte, unvoreingenommene Analysen und deutlich größere Stichproben.
Mit Cytely haben wir im Handumdrehen Tausende von Zellen analysiert und präzise bestimmt, welche transfiziert, infiziert oder beides waren. Was drei Jahre lang ein unüberwindbares Hindernis war, haben wir in unserer ersten Sitzung gelöst.
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