Compartiments cutanés d'une coupe colorée au PAS
Une coupe de peau humaine colorée au PAS. Cytely délimite la kératine, l'épiderme, le derme papillaire, le derme réticulaire et les glandes comme des régions nommées et détecte 664 noyaux dans tout le tissu. Ouvrez les résultats partagés pour vérifier chaque contour sur l'image à côté de la surface de chaque compartiment.
Méthodologie
Une seule image RVB en fond clair, recadrée à partir d'un scan de lame entière. Le tissu est séparé du fond, puis chaque compartiment est défini par la couleur de sa coloration : la kératine en séparant les deux colorants, l'épiderme comme la bande dense riche en noyaux, et le derme papillaire, le derme réticulaire et les glandes par plage de couleur. Des filtres de taille, une fermeture et un remplissage des trous nettoient chaque masque, et les compartiments sont rendus mutuellement exclusifs. Les noyaux sont détectés sur le signal violet foncé dans le tissu et séparés par ligne de partage des eaux (watershed) ; les noyaux situés dans la kératine sont retirés. Les surfaces sont exprimées en pixels.
Attribution
Image: PAS-stained human skin tissue, cropped from file HC23-00606-B1-1-PAS.jpg of "DERMA-PASeg" by Anum Abdul Salam, Muhammad Usman Akram and Babar Rao (2024), figshare, Dataset, doi: 10.6084/m9.figshare.27679044.v1. Licensed under CC BY 4.0. Modified: cropped from the original image.
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