Analyse de proximité et de voisinage cellulaires

Utilise les coordonnées des cellules et les identités définies par les marqueurs pour quantifier la proximité, la composition du voisinage, le regroupement et l'infiltration dans les images.

Illustration de Analyse de proximité et de voisinage cellulaires
Canaux d'entrée
  • Ch1: DAPI, Hoechst, or hematoxylin
  • Ch2-4: markers used to classify cell populations
  • Optional annotated tissue boundary or region mask
Mesures de sortie
  • Nearest-neighbour distance by cell-type pair
  • Number and composition of cells within a defined radius
  • Homotypic and heterotypic clustering metrics
  • Distance to tissue, tumour, or compartment boundary
  • 2D infiltration depth and density by region

Tout ce dont vous avez besoin pour analyse de proximité et de voisinage cellulaires

Une analyse automatisée, reproductible et sans code dans le cloud

Dans le cloud

Aucun logiciel à installer, aucun GPU requis. Lancez des analyses depuis n'importe quel navigateur, sur n'importe quel appareil.

Entièrement automatisé

Téléversez vos images et obtenez des résultats prêts à publier. Aucune programmation ni script nécessaire.

Reproductible

Chaque analyse est enregistrée et reproductible. Partagez vos protocoles avec vos collaborateurs en un instant.

Comment ça fonctionne

Cytely automatise l'analyse d'images pour que vous puissiez vous concentrer sur la science.

01

Segmenter et classer les cellules

02

Conserver les coordonnées des centroïdes

03

Éventuellement définir des régions ou des frontières tissulaires

04

Calculer les distances par paires et les voisinages fondés sur un rayon

05

Synthétiser par population et par condition.

Compatibilité

Prêt à l'emploi1

Proximité tumeur–immunité, regroupement des cellules immunitaires, voisinages en culture mixte, analyse cœur versus marge, composition de niche de base, proximité des cellules positives pour un marqueur dans des images multiplexées conventionnelles.

Nous consulter pour la prise en charge

Full CODEX/PhenoCycler/IMC high-plex workflows, cyclic image registration, advanced graph-community inference, or 3D neighbourhood analysis. This proposal assumes coordinate-derived measurements can be exposed reliably in the product, volumetric 3D neighbourhood analysis.

1 Dépend de la qualité de l'échantillon

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Chief Scientific OfficerOrganisation de recherche sous contrat européenne

L'approche fondée sur les données qu'offre Cytely est un rêve pour un microscopiste expérimenté comme moi.

Professor in Muscle BiologyGrande université de recherche européenne

Cela élimine totalement les biais. Le coût est négligeable au regard du temps consacré à l'analyse d'images.

Hematology ResearcherChercheur en hématologie

C'est tout simplement incroyable ce que l'on peut faire aujourd'hui ! Cytely fait tout le travail à ma place !

Infection Medicine ResearcherDoctorant, Lund University

Cytely me rend 10 fois plus rapide. Il me fait gagner des heures sur chaque expérience.

Alex Evilevitch
Alex EvilevitchProfesseur, Lund University

Les enseignements que nous avons tirés de Cytely ont été une expérience véritablement transformatrice. Ils nous ont permis de repenser notre expérience et de faire enfin avancer le projet.

SwathiChercheuse en mécanobiologie du cancer

Cytely a considérablement raccourci nos délais tout en renforçant la fiabilité des données, grâce à une analyse automatisée et impartiale et à des échantillons nettement plus grands.

Blazej Cegielski
Blazej CegielskiLaboratoire de biophysique des virus

Avec Cytely, nous avons analysé instantanément des milliers de cellules pour identifier avec précision lesquelles étaient transfectées, infectées, ou les deux. Ce qui constituait un blocage depuis trois ans a été résolu dès notre première session.

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