Análisis de proximidad celular y vecindario
Utiliza las coordenadas celulares y las identidades definidas por marcadores para cuantificar la proximidad, la composición del vecindario, el agrupamiento y la infiltración en imágenes.
- Ch1: DAPI, Hoechst, or hematoxylin
- Ch2-4: markers used to classify cell populations
- Optional annotated tissue boundary or region mask
- Nearest-neighbour distance by cell-type pair
- Number and composition of cells within a defined radius
- Homotypic and heterotypic clustering metrics
- Distance to tissue, tumour, or compartment boundary
- 2D infiltration depth and density by region
Todo lo que necesita para análisis de proximidad celular y vecindario
Análisis automatizado, reproducible y sin código en la nube
Basado en la nube
Sin software que instalar, sin GPU. Ejecute análisis desde cualquier navegador en cualquier dispositivo.
Totalmente automatizado
Cargue sus imágenes y obtenga resultados listos para publicación. Sin necesidad de programar ni escribir scripts.
Reproducible
Cada análisis queda registrado y es reproducible. Comparta protocolos con sus colaboradores al instante.
Cómo funciona
Cytely automatiza el análisis de imágenes para que usted pueda centrarse en la ciencia.
Segmentar y clasificar las células
Conservar las coordenadas de los centroides
Opcionalmente definir regiones o límites del tejido
Calcular las distancias por pares y los vecindarios basados en radio
Resumir por población y condición.
Compatibilidad
Listo para ejecutar1
Proximidad tumor–célula inmunitaria, agrupamiento de células inmunitarias, vecindarios en cultivos mixtos, análisis de núcleo frente a margen, composición básica de nichos, proximidad de células positivas para marcadores en imágenes multiplexadas convencionales.
Consultar disponibilidad
Full CODEX/PhenoCycler/IMC high-plex workflows, cyclic image registration, advanced graph-community inference, or 3D neighbourhood analysis. This proposal assumes coordinate-derived measurements can be exposed reliably in the product, volumetric 3D neighbourhood analysis.
1 Depende de la calidad de la muestra
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