Cytely unterstützt eine Vielzahl von Mikroskopie-Dateiformaten großer Hersteller sowie offene Standardformate. Diese Anleitung listet die unterstützten und nicht unterstützten Formate auf, damit Sie Ihre Daten optimal für die Analyse vorbereiten können.

Unterstützte Dateiformate

Die folgenden Formate werden in Cytely vollständig unterstützt:

  • TIFF (.tif, .tiff) - Offenes Standardformat für Mikroskopiebilder
  • OME-TIFF (.ome.tiff, .ome.tif) - Format der Open Microscopy Environment mit eingebetteten Metadaten
  • Nikon ND2 (.nd2) - Natives Format von Nikon. Hinweis: Pro Bilddatei ist ein einzelnes Sichtfeld erforderlich
  • Zeiss CZI (.czi) - Natives Format von Zeiss. Hinweis: Pro Bilddatei ist ein einzelnes Sichtfeld erforderlich
  • Leica LIF (.lif) - Natives Format von Leica. Hinweis: Pro Bilddatei ist ein einzelnes Sichtfeld erforderlich
  • Evident/Olympus OIB (.oib) - Natives Format von Olympus/Evident. Hinweis: Pro Bilddatei ist ein einzelnes Sichtfeld erforderlich

Nicht unterstützte Dateiformate

Die folgenden Formate werden derzeit nicht unterstützt:

  • JPG/JPEG (.jpg, .jpeg) - Verlustbehaftetes Kompressionsformat, für quantitative Analysen ungeeignet
  • PNG (.png) - Webbildformat ohne Mikroskopie-Metadaten
  • Nikon NIS-Elements (.nis) - Verwenden Sie stattdessen den ND2-Export
  • Zeiss LSM (.lsm) - Älteres Konfokalformat von Zeiss, verwenden Sie stattdessen CZI
  • Leica LOF (.lof) - Leica Object Format, verwenden Sie stattdessen LIF
  • Evident/Olympus OIF (.oif) - Verwenden Sie stattdessen den OIB-Export

Wichtige Anforderungen

Bitte beachten Sie bei der Arbeit mit Bilddateien in Cytely die folgenden Anforderungen:

Ein einzelnes Sichtfeld pro Datei: Proprietäre Formate (ND2, CZI, LIF, OIB) erfordern, dass jede Bilddatei nur ein einzelnes Sichtfeld enthält. Dateien mit mehreren Positionen werden nicht unterstützt.

Einheitliche Einstellungen im gesamten Datensatz: Alle Bilder eines Datensatzes müssen dieselben Aufnahmeeinstellungen haben, einschließlich Abmessungen, Bittiefe und Kanalkonfiguration.

Alle Kanäle in einer Datei: Mehrkanaldaten müssen mit allen Kanälen in einer einzigen Datei gespeichert werden, statt auf mehrere Dateien verteilt zu sein.

Benötigen Sie Hilfe mit einem bestimmten Format? Kontaktieren Sie unser Support-Team, um Ihre Anforderungen an Dateiformate zu besprechen.