DNA Damage & Genotoxicity - Foci Counting per Nucleus
DNA 손상 물질에 두 가지 농도로 노출한 뒤 핵과 DNA 손상 foci를 염색한 세포입니다. 이 예시 데이터셋은 핵당 손상 foci를 계수하고, 핵 형태로 게이팅하여 응집체를 제외하고, 처리군 간 평균 foci 수를 비교하는 방법을 보여줍니다. 핵당 foci 수는 손상 물질의 농도에 따라 증가합니다.
데이터 포인트525
응용 분야
신약 개발암 연구세포생물학
라이선스학술 이용 전용
실제 작동 보기
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방법론
DNA 손상 물질을 두 가지 농도로 처리한 세포의 핵과 DNA 손상 foci를 담은 2채널 형광 이미지. 핵은 Segment Cell Nuclei로 분할하고 Fill Holes로 정리합니다. Foci는 FFT 하이패스 필터로 강조한 뒤 Overlapping Background Segmentation으로 분할하며, 같은 라벨을 공유하는 인접 foci는 피크 시더와 플러드 필로 분리합니다. Associate Objects와 Join Sub Objects로 각 foci를 상위 핵에 할당하고 계수합니다. 결과에서는 핵 면적 대 둘레 그래프로 응집체를 게이팅하여 제외하고, 점 그래프로 핵당 foci 수를 표시하며, 막대 그래프로 세포군별 평균 foci 수를 비교합니다.
출처 표시
기여자Aris Polyzos
소속 기관Lawrence Berkeley National Laboratory
인용 형식
Images provided by Aris Polyzos at Lawrence Berkeley National Laboratory.
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