PAS染色切片の皮膚コンパートメント

PAS染色したヒト皮膚の切片です。Cytelyは角質層、表皮、乳頭層真皮、網状層真皮、腺を名前付き領域として輪郭を描き、組織全体で664個の核を検出します。共有された結果を開くと、各コンパートメントの面積とあわせて、すべての輪郭を画像上で確認できます。

PAS染色切片の皮膚コンパートメント
664件の検出
データポイント664

手法

全スライドスキャンからトリミングした明視野RGB画像1枚です。組織を背景から分離し、各コンパートメントを染色の色で定義します。角質層は2つの染色を分離して、表皮は核の密な帯として、乳頭層真皮・網状層真皮・腺は色の範囲で定義します。サイズフィルター、クロージング、穴埋めで各マスクを整え、コンパートメント同士が重ならないようにします。核は組織内の濃い紫の信号から検出し、ウォーターシェッドで分割します。角質層内の核は除外します。面積はピクセル単位で報告されます。

帰属情報

貢献者Anum Abdul Salam, Muhammad Usman Akram, Babar Rao
年2024
ライセンスCC BY 4.0
引用形式
Image: PAS-stained human skin tissue, cropped from file HC23-00606-B1-1-PAS.jpg of "DERMA-PASeg" by Anum Abdul Salam, Muhammad Usman Akram and Babar Rao (2024), figshare, Dataset, doi: 10.6084/m9.figshare.27679044.v1.

Licensed under CC BY 4.0. Modified: cropped from the original image.

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