Nuclear Translocation Benchmark (BBBC014v1)

BBBC014ベンチマーク由来の2チャネル取得データ（DAPI核対比染色 + FITC NF-κBシグナル）です。TNF-αに応答したMCF7細胞およびA549細胞における転写因子NF-κBの細胞質から核への移行を扱います。Cytelyは核と周囲の細胞質をセグメンテーションし、細胞ごとの核/細胞質NF-κB強度比を報告します。この比はTNF-αに対して用量依存的に上昇します。

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Nuclear Translocation Benchmark (BBBC014v1)

ライセンスcc-by-3

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帰属情報

貢献者Ilya Ravkin

所属機関Broad Bioimage Benchmark Collection

DOI10.1038/nmeth.2083

引用形式

We used image set BBBC014v1 provided by Ilya Ravkin, available from the Broad Bioimage Benchmark Collection [Ljosa et al., Nature Methods, 2012; doi: 10.1038/nmeth.2083]. https://bbbc.broadinstitute.org/BBBC014

NF-κB cytoplasm-to-nucleus translocation in MCF7 (breast adenocarcinoma) and A549 (alveolar basal epithelial) cells in response to TNF-α. License: CC BY 3.0 Unported.

このデータセットで使用されているアッセイ

Protein Localization & Colocalization

核内移行

刺激に応答したタンパク質の核と細胞質間の再分布を測定します(例: YAP、NF-κB、FOXO、p65)。

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