Lysosomal pH Activity in FaDu and HGFb Cells

オートファジー調節剤で処理したFaDu細胞およびHGFb細胞の4チャネル共焦点取得データです。オートファゴソームはタンデムのTagRFP/Emerald-GFPで標識され(GFPはpH 6未満でクエンチされ、TagRFPは安定を保ちます)、リソソームはLysoTrackerで標識されており、酸性度のレシオメトリックな読み出しが得られます。CytelyはリソソームをセグメンテーションしBafilomycinやBEZを含む薬剤処理群にわたって細胞ごとにリソソーム数を報告します。

Lysosomal pH Activity in FaDu and HGFb Cells
ライセンスCC BY 4.0

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手法

4チャネル共焦点Zスタック。Ch1: TagRFP(酸非感受性);Ch2: 透過光;Ch3: Emerald GFP(酸感受性、pH 6未満でクエンチ);Ch4: LysoTracker(酸感受性、酸性リソソームを標識)。酸感受性チャネルと酸非感受性チャネルを比較することで、リソソーム/オートリソソームの酸性度のレシオメトリックな読み出しが得られます。

帰属情報

貢献者Jan Balvan, Jiri Navratil
2022
引用形式
Balvan, Jan; Navratil, Jiri (2022). Autophagosomal/autolysosomal/lysosomal dynamics of FaDu and HGFb cells affected by autophagy modulators (dataset of dual labeling of autophagosomes and labeling lysosomes, confocal microscopy) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7116549

License: CC BY 4.0.

Relevant paper: Hanelova K, Raudenska M, Kratochvilova M, Navratil J, Vicar T, Bugajova M, Gumulec J, Masarik M, Balvan J. Autophagy modulators influence the content of important signalling molecules in PS-positive extracellular vesicles. Cell Communication and Signaling. 2023;21(1):120. doi: 10.1186/s12964-023-01126-z.

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