データポイント525
応用分野
創薬がん研究細胞生物学
ライセンス学術利用のみ
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手法
DNA損傷剤を2種類の濃度で処理した細胞の、核とDNA損傷フォーサイの2チャネル蛍光画像。核はSegment Cell Nucleiでセグメンテーションし、Fill Holesで整えます。フォーサイはFFTハイパスフィルターで強調した後、Overlapping Background Segmentationでセグメンテーションします。同じラベルを共有する隣接フォーサイは、ピークシーダーとフラッドフィルで分離します。Associate ObjectsとJoin Sub Objectsで各フォーサイを親となる核に割り当てて計数します。結果では、核の面積と周囲長のプロットで凝集体をゲーティングにより除外し、ドットプロットで核あたりのフォーサイ数を表示し、棒グラフで細胞群ごとの平均フォーサイ数を比較します。
帰属情報
貢献者Aris Polyzos
所属機関Lawrence Berkeley National Laboratory
引用形式
Images provided by Aris Polyzos at Lawrence Berkeley National Laboratory.
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