Ce guide vous accompagne tout au long du flux de travail d'analyse de données de microscopie avec Cytely, de la connexion à l'exploration de vos résultats dans un tableau de bord interactif.

Premiers pas

Comment accéder à Cytely ?

Connectez-vous simplement à votre compte Cytely sur app.cytely.io. Une fois connecté, vous pouvez importer et analyser vos données de microscopie.

Import et configuration des données

Comment importer mes données de microscopie ?

Importez vos fichiers de microscopie en les glissant-déposant directement dans l'interface de Cytely. La plateforme prend en charge divers formats de fichiers de microscopie et gère les images multicanal.

Quelle configuration est nécessaire avant l'analyse ?

Après l'import, vous devez configurer votre jeu de données en :

  • sélectionnant le grossissement de l'objectif utilisé lors de l'imagerie (par exemple 10x, 20x, 40x)
  • attribuant des libellés aux différents canaux de l'image (par exemple marqueur cellulaire, marqueur de proie, noyau, etc.)

Analyse et résultats

Comment lancer l'analyse ?

Une fois votre jeu de données configuré, cliquez sur le bouton d'analyse pour lancer le traitement. Les algorithmes de Cytely, alimentés par l'IA, détectent et segmentent automatiquement les cellules, mesurent leurs caractéristiques et extraient des données quantitatives de vos images.

Comment saurai-je que mon analyse est terminée ?

Vous recevrez une notification par e-mail lorsque votre analyse sera terminée. Vous pouvez ainsi vous consacrer à d'autres tâches pendant que Cytely traite vos données.

Exploration des données

Quels outils de visualisation sont disponibles ?

Cytely propose un tableau de bord interactif doté de plusieurs outils de visualisation :

  • Cartes d'ensemble montrant la distribution spatiale de vos données
  • Vignettes des objets détectés pour l'inspection visuelle des cellules individuelles
  • Nuages de points pour analyser les relations entre différentes mesures
  • Histogrammes montrant la distribution des caractéristiques cellulaires

Comment filtrer et analyser des populations cellulaires spécifiques ?

Vous pouvez créer des « fenêtres » (gates) sur les nuages de points pour filtrer vos données et vous concentrer sur des sous-ensembles précis de votre échantillon. Vous pouvez ainsi isoler des populations d'intérêt selon n'importe quelle combinaison de paramètres mesurés (taille, intensité, morphologie, etc.).

Puis-je donner mon avis sur la qualité de l'analyse ?

Oui ! Cytely intègre un système de retour qui vous permet d'évaluer la précision de l'analyse. Vos retours contribuent à améliorer les algorithmes d'IA de la plateforme et garantissent de meilleurs résultats pour les analyses futures.