Guía completa de los formatos de archivo de microscopía compatibles y no compatibles en Cytely, incluidos los requisitos para TIFF, OME-TIFF, ND2, CZI, LIF, OIB y otros formatos específicos de cada proveedor.
Cytely admite una amplia gama de formatos de archivo de microscopía de los principales fabricantes, así como formatos de estándar abierto. Esta guía enumera los formatos compatibles y no compatibles para ayudarle a preparar sus datos para el análisis.
Formatos de archivo compatibles
Los siguientes formatos son totalmente compatibles con Cytely:
- TIFF (.tif, .tiff): formato abierto estándar para imágenes de microscopía
- OME-TIFF (.ome.tiff, .ome.tif): formato de Open Microscopy Environment con metadatos integrados
- Nikon ND2 (.nd2): formato nativo de Nikon. Nota: se requiere un único campo de visión por archivo de imagen
- Zeiss CZI (.czi): formato nativo de Zeiss. Nota: se requiere un único campo de visión por archivo de imagen
- Leica LIF (.lif): formato nativo de Leica. Nota: se requiere un único campo de visión por archivo de imagen
- Evident/Olympus OIB (.oib): formato nativo de Olympus/Evident. Nota: se requiere un único campo de visión por archivo de imagen
Formatos de archivo no compatibles
Actualmente no se admiten los siguientes formatos:
- JPG/JPEG (.jpg, .jpeg): formato de compresión con pérdida, no adecuado para el análisis cuantitativo
- PNG (.png): formato de imagen web sin metadatos de microscopía
- Nikon NIS-Elements (.nis): utilice en su lugar la exportación a ND2
- Zeiss LSM (.lsm): formato confocal antiguo de Zeiss; utilice CZI en su lugar
- Leica LOF (.lof): Leica Object Format; utilice LIF en su lugar
- Evident/Olympus OIF (.oif): utilice en su lugar la exportación a OIB
Requisitos importantes
Al trabajar con archivos de imagen en Cytely, tenga en cuenta los siguientes requisitos:
Un único campo de visión por archivo: los formatos propietarios (ND2, CZI, LIF, OIB) requieren que cada archivo de imagen contenga un único campo de visión. No se admiten archivos multiposición.
Configuración coherente en todo el conjunto de datos: todas las imágenes de un conjunto de datos deben tener la misma configuración de adquisición, incluidas las dimensiones, la profundidad de bits y la configuración de canales.
Todos los canales en un único archivo: los datos multicanal deben almacenarse con todos los canales en un único archivo, en lugar de repartidos en varios archivos.
¿Necesita ayuda con un formato específico? Póngase en contacto con nuestro equipo de soporte para comentar sus requisitos de formato de archivo.