En microscopía, la transición de la observación cualitativa a los datos cuantitativos supone un desafío importante. El análisis manual es susceptible al sesgo del usuario y resulta poco práctico para grandes conjuntos de datos, mientras que muchas soluciones automatizadas pueden ocultar la conexión entre los datos cuantitativos y el contexto visual original. Cytely es una herramienta basada en la web diseñada para abordar estos desafíos integrando la segmentación automatizada de imágenes con la exploración interactiva de datos. Proporciona un flujo de trabajo estructurado para derivar métricas cuantitativas de poblaciones celulares y vincular esas métricas nuevamente con sus imágenes de origen en tiempo real.
Para facilitar esta transición de las imágenes sin procesar a datos útiles, Cytely se basa en un conjunto de funcionalidades principales. Cada una está diseñada para procesar, analizar y visualizar sistemáticamente la información celular, garantizando que los resultados cuantitativos permanezcan directamente vinculados a su origen visual.
Funcionalidades principales de la plataforma:
Segmentación y medición automatizadas de objetos: El software realiza primero la detección y segmentación automatizadas de los objetos, normalmente núcleos, dentro de una imagen. Para cada objeto identificado, calcula un conjunto de parámetros morfológicos y de intensidad, como el área, la circularidad, la longitud de los ejes mayor y menor, y la intensidad media de fluorescencia por canal. Este proceso genera un conjunto de datos completo que representa toda la población celular.
Visualización interactiva de datos y selección (gating): Los datos cuantitativos se presentan en diagramas de dispersión interactivos. Los usuarios pueden representar cualquier parámetro medido frente a otro para visualizar la distribución de las poblaciones. En estos diagramas se pueden dibujar regiones de interés, o "gates", para aislar subpoblaciones específicas. Esto permite filtrar de forma objetiva restos celulares y agregados, o seleccionar células según criterios fenotípicos concretos (p. ej., fluorescencia alta o un tamaño determinado).
Vinculación directa entre imagen y datos: Una característica clave del flujo de trabajo es el vínculo permanente entre los puntos de datos de los diagramas de dispersión y las células de la imagen original. Al seleccionar una población en un diagrama, se resaltan inmediatamente las células correspondientes en la imagen de origen y se muestran como miniaturas recortadas individuales. Este ciclo de retroalimentación visual es fundamental para verificar las estrategias de selección y confirmar la morfología de las subpoblaciones analizadas.
Este enfoque ofrece un método más objetivo y reproducible para tareas como el recuento celular, el control de calidad y la identificación de poblaciones celulares fenotípicamente distintas dentro de una muestra compleja.