Cytely로 분석한 데이터를 발표하는 경우, Methods(방법)에 Cytely를 명시하고, Data Availability(데이터 이용 가능성) 진술문에 Cytely 발간물 링크를 포함하며, 사용한 분석 워크플로를 간략히 기술해 주시기 바랍니다.
1. Methods 섹션에 Cytely를 인용하십시오
이미지 분석이 Cytely를 사용하여 수행되었음을 기술하고, 독자가 주요 분석 단계를 이해할 수 있도록 충분한 세부 정보를 포함해 주십시오. Methods 문구 예시:
"이미지 분석은 Cytely를 사용하여 수행하였다. 개별 세포/핵은 [채널/염색] 채널로부터 [분할 방법]을 사용하여 분할하였다. 형광 강도, 형태 및 공간적 특징은 단일 세포 해상도로 정량화하였다. 세포는 [기준을 간략히 기술, 예: 크기, 핵 강도, 마커 강도, 형태 또는 수동으로 정의한 게이트]에 따라 필터링 및 게이팅하였다. 이렇게 얻은 단일 세포 측정값을 [생물학적 판독값을 간략히 기술]의 후속 분석에 사용하였다."
내부 구현의 세부 사항을 모두 기술할 필요는 없습니다. 대신 다음을 포함하여 워크플로의 주요 단계를 기술해 주십시오: 어떤 이미지/채널을 분석했는지 세포, 핵 또는 기타 모 객체를 어떻게 분할했는지 해당되는 경우 어떤 자식 객체 또는 세포하 특징을 정량화했는지 어떤 측정값을 사용했는지 필터링, 게이팅 또는 분류를 어떻게 수행했는지
2. Cytely 출판용 링크를 포함하십시오
논문에서 분석한 데이터에 대한 Cytely 출판용 링크를 포함해 주십시오. Cytely 출판용 링크를 통해 독자와 심사자는 분석된 데이터셋을 열고, 게이트와 플롯을 살펴보고, 개별 데이터 포인트를 클릭하여 해당 세포 이미지를 확인하며, 원본 데이터를 변경하지 않고 분석을 검증할 수 있습니다. Cytely 출판용 링크를 준비하려면 Cytely에서 Share를 눌러 관련 데이터셋마다 읽기 전용 링크를 생성하십시오. 생성한 링크를 간단한 설명과 함께 Cytely 담당자 또는 support@cytely.io로 보내 주십시오. 그러면 Cytely가 최종 출판용 링크를 준비하고, 관련 데이터셋 기록이 출판을 위해 적절히 잠겨 있는지 확인합니다. 이는 논문에서 Cytely 데이터셋을 하나 사용하든 여러 개 사용하든 동일하게 적용됩니다. 여러 Cytely 데이터셋을 사용하는 논문의 경우, Cytely는 관련 데이터셋을 모두 나열하는 단일 출판용 링크를 만들어 드릴 수 있습니다.
공유 데이터셋 예시는 여기에서 확인하십시오: https://app.cytely.io/essential/c4a8fe20-e879-47db-b202-e790c0e5fb14/results/shared
권장 Data Availability 문구:
"본 연구에서 생성 및/또는 분석된 Cytely 데이터셋은 다음에서 이용할 수 있다: [Cytely 출판용 링크]"
3. Cytely 링크는 어디에 넣어야 하나요?
최소한 Data Availability 진술에 Cytely 출판용 링크를 포함해 주십시오. 필요한 경우, 특히 특정 데이터셋이 특정 그림이나 주장을 직접 뒷받침할 때는 그림 범례, Results 섹션 또는 Methods 섹션에도 Cytely 링크를 포함할 수 있습니다.
4. 데이터셋이 출판용으로 잠겨 있는지 확인하십시오
원고를 제출하기 전에 Cytely에 연락하시어 데이터셋이 출판용으로 적절히 잠기도록 해 주십시오. 이 절차를 시작하려면 Cytely Share 링크를 Cytely 담당자 또는 support@cytely.io로 보내 주십시오.