세포생물학에서 가장 중요한 질문 중 일부는 세포 자체가 아니라 세포 내부에 무엇이 있는가에 관한 것입니다. 세포당 미토콘드리아는 몇 개인가? 핵당 DNA 손상 병소는 몇 개인가? 호중구 핵의 엽은 몇 개인가? 생물학은 다양하지만 분석 문제는 동일합니다. 객체 안의 객체를 계수하고 모체에 다시 귀속시키는 것입니다.

과제는 계층적이라는 데 있습니다. 기존 워크플로는 한 단계의 분할은 깔끔하게 처리합니다. 두 단계는 노력이 필요합니다. 모체-자식 관계를 온전히 유지한 세 단계, 대부분의 도구는 여기서 한계에 부딪힙니다. 연구자들은 질문을 단순화하거나, 분석 과정에서 끊어진 관계를 다시 연결하기 위해 맞춤 스크립트에 며칠을 씁니다.

Cytely는 이 계층 구조를 기본적으로 처리합니다. 한 채널에서 세포를 분할하고, 다른 채널에서 하위 구조를 분할합니다. 모체-자식 관계는 자동으로 설정됩니다. 모든 객체는 자신의 계보를 지닙니다. 자식 객체 수, 자식 객체의 총 면적, 자식 객체의 평균 강도는 표준 측정값이 되어 다른 특징과 마찬가지로 게이팅과 플로팅에 사용할 수 있습니다.

그 결과, 중요한 질문에 대해 단일 세포 해상도를 얻을 수 있습니다. "웰 전체의 평균 병소 수는 얼마인가"가 아니라 "세포별 병소 분포를 보여 주고, 고반응 세포를 게이팅하게 해 달라"입니다. 이것이 흐릿한 집단 평균과 생물학적 통찰의 차이입니다.

어세이 실행 방식

모체 객체(예: 세포) 분할 → 각 모체 내에서 하위 객체 검출 → 모체별 하위 객체 수, 면적, 강도, 원형도 측정.

제공하실 데이터

  • Ch1: DAPI
  • Ch2: 모체 객체 채널(예: 세포체 염색)
  • Ch3: 하위 객체 채널(예: 소기관 마커)

제공되는 결과

  • 모체별 하위 객체 수
  • 모체별 총 하위 객체 면적
  • 평균 하위 객체 강도
  • 하위 객체 크기 분포

바로 실행 가능

세포당 소기관(미토콘드리아 단편, 리소좀, 엔도좀), 핵당 봉입체(핵 반점, Cajal body), 구획당 소포(분비 소포, 세포내이입 소포), 모체당 이중 하위 객체 세트(예: 수 비율을 갖는 두 가지 소기관 유형).

지원 문의

시간에 따른 하위 객체 추적, 모체 내 하위 객체 간 공간적 관계.

하위 객체 정량화 어세이 살펴보기 →