NF-κB의 핵 내 이동은 염증 생물학에서 가장 많이 연구된 사건 중 하나입니다. YAP/TAZ 왕복은 암과 재생에서 중요한 Hippo 경로의 판독값입니다. FOXO 전위는 인슐린 신호전달을 보고합니다. 이들은 신약 개발에서 가장 흔한 신호전달 경로 판독값에 속하며, 모두 하나의 숫자로 귀결됩니다. 바로 핵 대 세포질 강도 비율입니다.

기술적 과제는 강도를 측정할 위치를 정의하는 것입니다. 먼저 (DAPI로부터) 핵 마스크를 만들고, 이어서 세포질 마스크를 만든 다음, 두 영역에서 강도를 측정해야 합니다. 범용 도구로도 가능하지만, 새로운 실험마다 설정, 스크립팅 또는 파이프라인 구축이 필요합니다.

Cytely는 마스크 생성을 자동화합니다. 핵과 세포질을 분할하고, 핵을 빼고, 두 구획에서 표적 채널 강도를 측정하고, 비율을 계산합니다. 그 결과 용량에 대해 플롯하여 전위 곡선을 작성할 수 있는 세포별 N/C 비율이 산출됩니다.

어세이 실행 방식

DAPI로부터 핵 분할 → 근사 세포 경계까지 팽창 → 핵을 빼서 세포질 고리 생성 → 두 구획 모두에서 표적 채널 강도 측정 → 비율 계산.

제공하실 데이터

  • Ch1: DAPI(핵 염색)
  • Ch2: 표적 단백질(IF 또는 형광 태그)

제공되는 결과

  • 세포별 핵 대 세포질 강도 비율(N/C 비율)
  • 조건별 전위 세포 비율(%)

바로 실행 가능

YAP, NF-κB, FOXO, p65, STAT3, 모든 핵/세포질 왕복 단백질.

지원 문의

소기관 특이적 전위(예: ER에서 Golgi로).

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