비할 데 없는 손쉬움과 정확성으로 식세포 작용을 정량화하세요

식세포 작용 분석의 과제를 극복하세요. Cytely의 자동화된 데이터 기반 플랫폼은 면역학 및 세포생물학 연구를 위해 견고한 정량화, 동적 통찰, 그리고 표적을 정밀하게 겨냥한 고해상도 이미징을 제공합니다.

식세포 작용 측정의 어려움

식세포 작용은 면역 방어, 조직 항상성, 발생, 그리고 암과 같은 질환에 필수적인 기본 세포 과정입니다. 이 과정은 여러 단계로 이루어집니다. 수용체(예: Fc 수용체, 보체 수용체, 스캐빈저 수용체)를 통한 표적 입자의 인식, 내재화 기구를 활성화하는 신호 전달, 액틴 구동 돌기를 통한 파고솜의 형성, 그리고 마지막으로 분해를 위한 파고리소솜으로의 성숙입니다.

그 중요성에도 불구하고, 식세포 작용의 정량화는 전통적인 방법으로는 극히 어렵기로 잘 알려져 있습니다. 수작업 계수는 시간이 많이 걸리고 주관적이며 재현성이 떨어집니다. 유세포 분석은 높은 처리량을 제공하지만, 인공 산물을 만들어낼 수 있고, 결합된 입자와 내재화된 입자를 구별하기 어려우며, 동역학 정보를 거의 제공하지 못합니다. 많은 방법은 정적인 스냅샷만을 제공하여 과정의 동적인 특성을 놓칩니다. 회합(결합)과 실제 내재화를 구별하는 것도 종종 어렵습니다. 나아가 ImageJ나 CellProfiler 같은 분석 소프트웨어는 견고한 분석 파이프라인을 구성하고 검증하는 데 상당한 전문 지식과 시간을 요구하는 경우가 많아, 재현 가능한 정량화를 한층 더 복잡하게 만듭니다.

Cytely는 완전히 자동화된 Smart Microscopy 워크플로를 구현함으로써 이러한 과제를 해결합니다. 이 접근 방식은 지능형 이미지 취득(초기 스캔과 표적을 겨냥한 후속 촬영을 분리)과 정교한 실시간 분석을 결합하여, 최소한의 사용자 개입으로 식세포 작용에 관한 견고하고 정량적이며 동적인 정보를 제공합니다.

Cytely의 식세포 작용 워크플로

다음은 Cytely에서 이루어지는 식세포 작용 분석의 일반적인 워크플로를 보여줍니다:

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    샘플 준비 및 로딩

    적절한 플레이트 또는 슬라이드에서의 표준 세포 배양. Cytely 플랫폼에서 필요한 설정은 최소한입니다.

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    실험 시작("재생 누르기")

    사용자가 실험을 시작하면 Cytely가 자동 워크플로를 개시합니다.

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    초기 스캔

    시스템은 샘플 영역을 (흔히 낮은 해상도로) 빠르게 스캔합니다. 기계 학습을 이용한 실시간 세그멘테이션이 식세포와 표적 입자를 자동으로 식별합니다. 세포 수, 표적 수, 회합과 같은 초기 지표가 지속적으로 계산되어 좌표와 함께 저장됩니다.

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    표적 식별 및 Smart Microscopy 트리거링

    초기 스캔 동안 추출된 정량 데이터와 특징을 바탕으로, 시스템(또는 인터랙티브 플롯을 통한 사용자)이 미리 정의된 기준(예: 높은 취입 수준, 특정 형태, 개시된 삼킴 이벤트)을 충족하는 세포나 이벤트를 식별합니다.

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    Smart Microscopy

    Cytely는 선택된 표적의 좌표를 현미경으로 다시 보내고, 현미경은 이 표적들에 대해서만 고충실도 데이터를 취득하도록 자동으로 제어됩니다. 여기에는 고배율 이미지, 타임랩스 시퀀스, 공초점 Z-stack, 또는 기타 이미징 모드가 포함될 수 있습니다.

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    데이터 통합 및 시각화

    고품질 Smart Microscopy 데이터는 초기 스캔에서 얻은 집단 맥락과 자동으로 연결됩니다. 인터랙티브 플롯(산점도, 히스토그램, 동역학)과 이미지 갤러리가 즉시 생성됩니다. 사용자는 산점도에서 유세포 분석과 유사한 게이팅을 사용하여 이 데이터를 탐색할 수 있으며, 개별 세포 이미지 및 개요 지도와 연동된 뷰를 이용할 수 있습니다.

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    보고서 작성

    정량 데이터와 논문에 바로 사용할 수 있는 도표를 원클릭으로 내보냅니다.

식세포 작용 분석을 위한 핵심 기능 및 이점

Cytely에서 세포와 표적을 매끄럽게 세그멘테이션하는 시연

자동적이고 정확한 세포/표적 검출

Cytely는 고급 기계 학습을 활용하여, 밀집된 배양물이나 저대비 이미지에서도, 표지 없이 또는 마커를 사용하여 식세포와 표적 입자를 견고하게 세그멘테이션합니다...

식세포 작용 분석을 위한 Cytely의 인터랙티브 데이터 탐색 및 게이팅

인터랙티브 데이터 탐색 및 시각화

정적인 플롯을 넘어서세요. Cytely는 이미지 유세포 분석과 유사한 탐색을 가능하게 합니다. 산점도를 만들고, 하위 집단을 게이팅하며, 해당하는 세포 이미지를 즉시 확인하세요...

표적을 겨냥한 이미징을 위해 Data-Dependent Acquisition으로 현미경을 강화하는 Cytely

표적을 겨냥한 고충실도 이미징

Smart Microscopy는 식세포 작용 연구에 강력합니다. Cytely는 특정 세포를 자동으로 표적으로 삼아 고해상도 동영상, Z-stack, 타임랩스를 취득하여 심층적인 메커니즘 통찰을 제공합니다...

Cytely에서 게이팅과 연동된 시각적 분석으로 표시되는 집단 맥락

집단 맥락과 재현성

Smart Microscopy는 상세한 결과를 초기 스캔에서 얻은 전체 집단 맥락 안에 위치시킵니다. Cytely의 자동화된 워크플로는 편향을 최소화하여 높은 재현성을 보장합니다...

Cytely가 계산하는 핵심 식세포 작용 지표

Cytely는 식세포 작용의 다양한 측면을 정량화하기 위해 자동으로 계산되는 지표를 포괄적으로 제공하여, 견고하고 재현 가능한 통찰을 선사합니다.

지표설명Cytely의 계산 방식가치가 있는 이유
세포 수분석 대상 영역/샘플 내 식세포의 총 개수.세그멘테이션된 식세포의 자동 계수(기계 학습 기반).기본적인 정규화 파라미터.
표적 수분석 대상 영역/샘플 내 표적 입자의 총 개수.세그멘테이션된 표적 입자의 자동 계수(기계 학습 기반).MOP 계산에 사용됩니다.
회합률 (%)적어도 하나의 표적 입자와 회합된 식세포의 비율("지속적 회합"으로 정의).세그멘테이션된 식세포와 표적 사이의 겹침/근접을 식별합니다.정규화 및 용량-반응 분석에 사용할 수 있는 간단하고 측정 가능한 파라미터.
이미지 표적 다중도 (iMOP)전체 표적 입자 수 대비 전체 식세포 수의 비율.자동으로 계수된 세포와 표적으로부터 계산됩니다.중요한 실험 파라미터인 표적의 상대적 농도를 나타냅니다.
MOP50식세포의 50%가 지속적 회합을 나타내는 데 필요한 MOP.회합률 대 MOP의 용량-반응 곡선에서 결정됩니다.실험별 변이를 정규화하는 데 사용되어 비교의 견고성과 민감도를 높입니다.
식세포당 표적 수개별 식세포에 회합된/내재화된 표적 입자의 평균 개수와 분포.세그멘테이션된 각 식세포의 내부/근처에 있는 세그멘테이션된 표적 입자의 수를 계수합니다.취입 효율과 식세포 집단 내 이질성에 대한 통찰을 제공합니다.
식세포 작용 점수(양성 세포 비율) × (형광 강도 중앙값 - MFI) / 상수로 계산됩니다.회합 데이터(양성 비율)와 각 세포의 강도 측정값(MFI)을 결합합니다.활성 세포의 비율과 세포당 취입량을 모두 통합한 견고한 지표로, 정규화와 비교에 유용합니다.
내재화된 표적 면적식세포 내부에 위치한 표적 입자의 총 면적.식세포 세그멘테이션과 겹치는 세그멘테이션된 표적 객체의 면적을 측정합니다.실제로 내재화된 물질의 양을 기준으로 필터링과 분석을 가능하게 합니다.

리소스 및 추가 정보

데이터 기반 현미경 관찰 논문의 비주얼 초록

과학적 기반: 데이터 기반 현미경 관찰

Cell Rep Methods. 2023 Mar 6;3(3):100419. doi: 10.1016/j.crmeth.2023.100419.

Data-driven microscopy allows for automated context-specific acquisition of high-fidelity image data.

Oscar André, Johannes Kumra Ahnlide, Nils Norlin, Vinay Swaminathan, Pontus Nordenfelt.

논문 전문 읽기 (PMC10088093)