Lysosomal pH Activity in FaDu and HGFb Cells
자가포식(autophagy) 조절제로 처리한 FaDu 및 HGFb 세포를 4채널 공초점으로 촬영한 데이터셋입니다. 자가포식소체(autophagosome)에는 TagRFP/Emerald-GFP 탠덤 표지가 부착되어 있으며(GFP는 pH 6 이하에서 소광되는 반면 TagRFP는 안정적으로 유지됨), 리소좀은 LysoTracker로 표지되어 산성도를 비율 측정(ratiometric) 방식으로 읽어낼 수 있습니다. Cytely는 리소좀을 분할(segmentation)하고 Bafilomycin 및 BEZ를 포함한 약물 처리 그룹 전반에 걸쳐 세포당 리소좀 수를 산출합니다.
라이선스CC BY 4.0
실제 작동 보기
이 데이터셋이 Cytely에서 처음부터 끝까지 어떻게 분석되었는지 확인하세요.
방법론
4채널 공초점 Z-스택. Ch1: TagRFP(산 비감응성); Ch2: 투과광; Ch3: Emerald GFP(산 감응성, pH 6 이하에서 소광); Ch4: LysoTracker(산 감응성, 산성 리소좀 표지). 산 감응성 채널과 산 비감응성 채널을 비교하면 리소좀/자가리소좀 산성도를 비율 측정 방식으로 읽어낼 수 있습니다.
출처 표시
인용 형식
Balvan, Jan; Navratil, Jiri (2022). Autophagosomal/autolysosomal/lysosomal dynamics of FaDu and HGFb cells affected by autophagy modulators (dataset of dual labeling of autophagosomes and labeling lysosomes, confocal microscopy) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7116549 License: CC BY 4.0. Relevant paper: Hanelova K, Raudenska M, Kratochvilova M, Navratil J, Vicar T, Bugajova M, Gumulec J, Masarik M, Balvan J. Autophagy modulators influence the content of important signalling molecules in PS-positive extracellular vesicles. Cell Communication and Signaling. 2023;21(1):120. doi: 10.1186/s12964-023-01126-z.
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