マルチプレックスイメージングの最先端技術は大きな注目を集めています。CODEX、MIBI、IMC。一度に40以上のマーカー。いずれも重要な技術ですが、大多数の生物学研究はこうした方法では行われていません。解析の実際の様子はこちら:https://youtube.com/watch?v=UDzyReIdr-4
マルチプレックスイメージングの最先端技術が大きな注目を集めています。CODEX、MIBI、IMC。一度に40以上のマーカー。いずれも重要な技術ですが、大多数の生物学研究はこうした方法では行われていません。
実際の主力は、2〜4チャネルのIFパネルです。DAPIに加えて、1つの具体的な問いに答えるために選ばれた2〜3個のマーカー。このタンパク質はこの細胞種で発現しているか。その化合物は集団をシフトさせるか。マーカーAとBは共局在するか。こうした実験はあらゆる細胞生物学ラボで毎日行われており、ほとんどの論文のほとんどの図を支えています。
解析の課題は、顕微鏡のどこでも同じです。チャネルをまたいで細胞ごとの測定値を抽出し、そのうえで多パラメータデータについて推論することです。その概念的な枠組みはフローサイトメトリーによって発展させられました。2D散布図上で集団をゲーティングし、マーカーの組み合わせによってサブ集団を定義し、ゲートごとに割合を報告する、というものです。
Cytelyは、そのフロー式のゲーティングを画像にもたらします。細胞をセグメンテーションし、細胞ごとに全チャネルと形態特徴を測定し、任意の2D組み合わせでインタラクティブにゲーティングします。ゲーティングされたすべての細胞は、画像内のその位置にリンクバックされます。
2〜4チャネルのIFパネルこそが、すべてのCytelyワークフローが実験ごとのスクリプト作成なしに同一のプラットフォームから生み出される理由です。
アッセイの流れ
細胞をセグメンテーション → 細胞ごとに全チャネル強度と形態を測定 → インタラクティブなゲーティングを通じて多パラメータの関係性を探索。
ご提供いただくもの
- Ch1: DAPI
- Ch2-4+: マーカーチャネル(IF、蛍光タグ、またはマルチプレックス染色)
得られるもの
- 各マーカーの細胞ごとの強度
- 形態特徴
- 共発現プロファイル
- 集団レベルの分布
すぐに実行可能
2〜4チャネルのIFパネル、免疫表現型解析パネル、多標的の薬剤研究、核・細胞質・膜マーカーの任意の組み合わせ。
サポートについてお問い合わせください
スペクトルアンミキシング、サイクリックIF(逐次染色ラウンド)、5チャネル以上の同時取得。